常绿
灌木或
小乔木，高3-7米，树皮灰褐色或红褐色，裂成片状脱落；小枝对生或近对生，圆或近方形，一年生枝绿色，二、三年生枝黄绿色、黄色或淡黄红色；冬芽无树脂道，芽鳞交互对生，宿存于小枝基部。
叶对生，排成2列，具短柄，条状披针形，厚革质，直或微弯镰状，长2-3.7厘米，宽5-7毫米，先端尖或钝，基部宽楔形，边缘微反卷，上面深绿色，中脉隆起，下面有两条与绿色边带等宽或近等宽的粉白色气孔带。
雌雄异株，雄球花交互对生，排成穗状，通常2-4（稀1或5-6）穗生于小枝顶端，长仅1.5-5.5厘米，每雄花具2-5（多为3）花药；雌球花生于当年生枝的叶腋或茎腋，梗较长，有6-10对交互对生的苞片，胚珠单生。种子翌年成熟，下垂，椭圆形，被囊状假种皮所包，长约1.9厘米，直径1厘米，先端具极短尖头，成熟时假种皮鲜红色，基部具宿存的苞片，种梗长1-1.4厘米，扁四棱形。
生长于南亚热带喀斯特地区常绿落叶阔叶混交林下,要求立地条件苛刻,土壤为黑色石灰土,PH值在7-7.5之间,土层厚度20-80厘米,石砾含量5-15%,水分充足,林内相对湿度>70%,海拔980-1020米,坡向阴坡,坡度15°-35°,坡位中上。
国家级保护植物。到目前为止，未见对云南穗花杉人工驯化及引种栽培的报道，尚需进行深入研究，用种子育苗，亦可扦插繁殖，待种子成熟采收后，用清水洗净红色假种皮，晾干后沙藏至第二年春播，幼苗需遮荫，当苗高30-50厘米后可出圃栽植。
分布区受季风影响，干、湿季分明，5--10月为雨 季，11--4月为旱季，年降水量约1500毫米，雾多，
湿度大。土壤为棕色石灰岩土，排水良好。云南穗花衫喜阴湿环境，为森林中、下层成分。
云南穗花杉喜阴湿，在森林中常为中下层林木，如兴义1号样地；海拔1850米，坡向西南，坡度60-90°，上层树种多为栎类（Quercus spp.）覆盖度50%，灌木层多为
海桐（Pittosporum spp.）、
野扇花（Sarcococca ruscifolia）、覆盖度前种占25%，后者15%；草本层主要为楼梯草（Elatostema spp.）及
蕨类植物。样地内仅见13株幼树，和18株不同年龄高5—150厘米的实生苗。六枝老王山，海拔1750—2126米，年均温度10.5—13℃，土壤为黄棕壤，山坡陡峭，森林保存较好，在1820米以下土层较深厚，肥沃，上层树种为
巴东栎（Quercusengleriana）、
多脉青冈（Cyclobalanopsis multinervis）、
建润楠（Machilus oreophilus）、
西南山茶（Camellia pitardii）、头状四照花（Cornus capilata）、
化香（Platycarya strobiacea）、镰包鹅耳枥（Carpinusfaicatibracteata）、莱木（Cornus macrophylla）等。灌木层主要为方竹（Chimonobambusaspp.），高2-3米，密度很大，致云南穗花杉受到挤压，生长发育不良，自然更新差，多呈灌木状，草本极不发育，仅偶见报春花（Primulaspp.)。由1820米至山顶，土壤逐渐趋于瘠薄，上层林木树高4一5米，主要有红豆杉（Taxus chinensis)、云南穗花杉、
菱叶钓樟（Lindera supracostata)、
南烛（Lyoniaovatifolia)、
嵩明省沽油（Staphyleaforr estii).
百合花杜鹃（Rhododendron liliiflorum)等；灌木层方竹逐渐为箭竹（Sinarundinariaspp.）取代，高约1米，其它为
异叶梁王茶（Nothopanaxdavidii）、叶下珠（Phyllanthus spp.）、
倒心叶珊瑚（Aucubaobcordata）、茵芋（Skimmiareeresiana）等及乔木层种类的幼树。浅根性树种，根系发达，特别是生长在岩石裸露，土层浅薄植株，其根系延伸范围较大。生长较缓慢，在土壤肥沃、深厚的条件下，5年生树高约1米，反之更慢。花期4月，雌雄花常不同期成熟，就是雌球花授粉时亦不及时受精，需2-3个月后花粉管才萌发，胚的发育又得经过漫长的冬季，种子第二年5-6月成熟，成熟的种子又有一个
休眠期，需到第二年春季才能发芽，这期间极易遭受鸟、鼠害。这些是导致该物种濒危稀少的主要原因。
保护价值：为分布狭窄的
稀有种，对保存物种和研究穗花衫属分类、分布等有一定意义。
保护措施：云南
西畴县小桥沟已划为自然保护区，应将云南穗花衫列入保护对象或引入栽培，并进行采种育苗造林，以扩大森林面积。
穗花杉特产于中国亚热带中西部地区，多分布在低山阴湿沟谷林中，零散稀少，是国家三级保护植物。
穗花杉生长缓慢，木材材质细密，为优质工艺用材。穗花杉穗状球花集生，种籽大，假种皮鲜红，长梗悬垂，极为艳丽，是珍贵的观赏树种。江西官山海拔400——500米的沟谷溪边有穗花杉自然林200余亩，树高10米左右，胸围40——60厘米，根据年轮实测，树龄多在150——200年