矢矧号竣工后,在昭和十九年(1944)三月一日编入了新编成的第一机动舰队的中心-第三舰队,代替在二月沉没的
姊妹舰阿贺野号担任第十战队的旗舰,率领麾下十五只的驱逐舰,与
姊妹舰能代号一起出击
马里亚纳海战.接下来,在雷伊太大海战里率领着
水雷战队编于栗田舰队中.姊妹舰能代号在此役中遭击沉,而矢矧号本身则是受到若干伤害,自行航行到文莱泊地.
之后,在昭和十九年(1944)十一月十五日的再编组中,担任第二水雷战队的旗舰,率领着第十七驱逐队(浦风,滨风,矶风,雪风)支持对雷伊太岛的输送作战,并且担任对在莱特湾海战中受伤的战舰大和号,金刚号和长门号护送回国的护航任务.而自己也回到吴港接受修理.
昭和二十年(1945)四月,美军登上
冲绳岛,联合舰队派出最后一只兵力打算执行自杀性的特殊攻击,以巨大战舰大和号为中心的特攻舰队将图入冲绳海域,并尽一切能力消灭所看到的敌人,最后还要搁浅在岛旁,全员上陆继续进行战斗.而轻巡洋舰矢矧号也在其中之一.除了大和号,矢矧号之外,剩下的只有八艘驱逐舰,联合舰队的悲凄由此可见一斑.四月六日,特攻舰队浩浩荡荡的由德山湾出击,并在隔日七日遭受到有如云彩般波波袭来的
美军舰载机的攻击,矢矧号身中八枚
鱼雷,
炸弹二十发,于午后二时和巨舰大和号一起沉没在九州外海.