这种把致病因素与发病途径结合起来进行研究的分类方法较之以往更为合理、明确，对后世影响很大，故延用，即将病因分为外感性致病因素、内伤性致病因素和其他致病因素三大类。

关于中医病因学的发展源流及分类，远在《内经》理论形成时期，即将病因分为阴阳两类。如《素问·调经论》说：“夫邪之生也，或生于阴，或生于阳。其生于阳者，得之风雨寒暑。其生于阴者，得之饮食居处，阴阳喜怒。” 汉代张仲景著《金匮要略》指出：“千般疢难，不越三条，一者，经络受邪入脏腑，为内所因也；二者，四肢九窍，血脉相传，壅塞不通，为外皮肤所中也；三者，房室、金刃、虫兽所伤。以此详之，病由都尽。”他将病因按其传变概括为三个途径。宋代陈无择著《三因极一病证方论》，在前人病因分类的基础上明确提出了“三因学说”，他说：“六淫，天之常气，冒之则先自经络流入，内合于脏腑，为外所因；七情，人之常性，动之则先自脏腑郁发，外形于肢体，为内所因；其如饮食饥饱，叫呼伤气，金疮踒折，疰忤附着，畏压溺等，有背常理，为不内外因。”始以六淫邪气为“外所因”，情志所伤为“内所因”，而饮食劳倦、跌仆金刃，以及虫兽所伤等则为不内外因。

阴阳五行学说为纲领

阴阳五行学说属古代哲学范畴，《易传·系辞上》曰：“一阴一阳之谓道”.中医学将阴阳五行学说应用到医学领域，广泛地阐释人体正常的生理活动、疾病现象，并用以指导诊断和治疗。在中医病因学形成发展过程中也是以阴阳五行学说为指导。

中医学最早关于病因及分类的解释即是运用阴阳五行学说。如秦国名医医和所提出的“六气病源”说，谓“六气，曰阴、阳、风、雨、晦、明也。分为四时，序为五节，过则为灾。阴淫寒疾，阳淫热疾，风淫末疾，雨淫腹疾，晦淫惑疾，明淫心疾”（《左传·昭公元年》）。天有六气，淫生六疾，。淫者，过也，即邪气。六气以阴阳为纲，淫之六疾统于阴阳。“六气病源”说被称为病因理论之创始。《内经》更以阴阳为纲领，对病因进行阐释和分类。《素问·调经论》说：“夫邪之生也，或生于阴，或生于阳。其生于阳者，得之风雨寒暑：其生于阴者，得之饮食居处，阴阳喜怒”。将邪气分为阴阳两大类，开后世病因分类之先导，并运用阴阳学说对属于阴或属于阳的邪气作了进一步深入说明。对生于阴者，《素问·阴阳应象大论》有：“暴怒伤阴，暴喜伤阳”之分；生于阳者，在《灵枢·百病始生》有：“风雨则伤上，清湿则伤下”之别。即天之气伤于上部肌表属阳，地之气袭人下部属阴。后人在《内经》的基础上对病因的阴阳分类又作进一步阐发。如王士雄在论述外感六气发病时，提出暑统风火均为阳，寒统燥湿均为阴（《温热经纬·外感温热篇》）；张介宾承《内经》“喜怒不节则伤脏，脏伤则病起于阴”之说，提出：“凡伤脏者，皆病起于阴”，但亦有“伤心者，病在阳”，“伤肾者，病在阴”的不同。可见阴阳学说被用于说明病因的属性，病因分类的纲领，据此分析各种邪气所引起的阴阳失调的病理变化。

整体观念为指导

《内经》在论述人体生命活动规律时强调，人是一个有机联系的整体，人体脏腑组织器官在组织结构上不可分割，生理功能上相互协调，病理上相互影响；人生活在自然界，与自然界有着密切的关系。由此形成人体局部与整体统一，人与自然统一的天人内外统一体，并以阴阳五行学说说明人体内外的联系：人体以五脏为中心，概属六腑、奇恒之腑及五体、五官、五志等外应自然界；以四时五行阴阳为中心，概属五方、五季、五气、五味等，形成四时五脏相通应的整体联系法则。这一观点反映在病因学方面，是从人与自然统一关系的破坏、机体本身整体联系失调两方面来认识致病因素。因而，在《内经》中，自然界气候变化，地域方土失宜，情志失调，饮食劳倦都作为致病因素来研究，并认为致病因素作用于人体所伤五脏及其所属，临床证候表现皆是以整体联系为基础的。

外邪致病的整体观。外邪是指自然界气候变化而生之淫邪。人生活在自然界，自然界的气候变化是导致疾病的主要外因，疾病的发生无不受自然规律的影响和制约，即《金匮要略》所谓：“夫人禀五常，因风气而生长，风气虽能生万物，亦能害万物。如水能浮舟，亦能覆舟”。外邪致病的整体观表现在：

①外邪致病有明显的季节性。《素问·生气通天论》有“春伤于风”“夏伤于暑”“秋伤于湿”“冬伤于寒”之说。《素问·金匮真言论》曰：“春善病鼽衄，仲夏善病胸胁，长夏善病洞泄寒中，秋善病风疟，冬善病痹厥”，都体现了六淫发病的整体观。

②外邪致病各随其脏气所应。外邪发病，内通五脏。《素问·阴阳应象大论》曰：“天之邪气，感则害人五脏”。吴昆注云：“风寒暑湿燥热，不当其位，是天之邪气也。风气入肝，寒气入肾，暑热之气入心，湿气入脾，燥气入肺，是害人之五脏也”。肝与春季相应，风气通于肝，风邪伤肝，春多肝病；肝开窍于目，主筋，故其病又多有目、筋的证候表现。故《素问·生气通天论》说：“风客淫气，精乃亡，邪伤肝也”，《素问·阴阳应象大论》说：“风伤筋”。

③外邪之生因地而异。地域有高下，气候有差异，邪因地而异。《素问·异法方宜论》有：东方者“鱼盐之地，海滨傍水，西方者“其民陵居而多风”，北方者“其地高陵居，风寒冰冽”，南方者“阳之所盛处也”，中央者”其地平以湿”。《素问·阴阳应象大论》谓“东方生风”、“南方生热”、“中央生湿”、“西方生燥”、“北方生寒”，都含有邪气因地域方位之不同而异的特点，故《内经》在研究外感邪气致病的规律时，地域方土是不可忽视的因素。

内伤七情与五脏相应的整体观。情志与五脏相应，病则首伤五脏。《素问·阴阳应象大论》说：“人有五脏化五气，以生喜怒悲忧恐”。情志活动归属五脏而称五志，脏腑气血是产生情志活动的基础，情志活动又是脏腑气血功能活动的一种表现形式。情志过用则会伤及五脏，如《灵枢·百病始生》说：“喜怒不节则伤脏”。根据情志与五脏的相应关系，而有“怒伤肝”、“喜伤心”、“悲伤肺”、“思伤脾”、“恐伤肾”之不同。又因心主神明，为“五脏六腑之大主，精神之所舍”，故情志所伤，五脏各有所属，总由于心。此外，《内经》对人的体质状态、自然界的变化、社会环境等因素在情志发病过程中的作用亦非常重视，这种将内外环境相结合研究情志发病的整体观，对现代生物——心理——社会医学模式具有启迪作用。

辨证求因为认识病因的方法

中医学认识病因，是采用由果析因的认识方法探求引起证候的原因，并由此认识疾病的病理过程，为治疗用药提供依据，即辨证求因。这种认识病因的方法亦源自《内经》。《灵枢·本藏》说：“视其外应，以知其内脏，则知所病矣”。《灵枢·外揣》更明确指出：“内外相袭，若鼓之应桴，响之应声，影之似形”，辨证求因的机理由是彰之。病因作用于人体，致机体产生病理变化，临床必出现相应的证候表现，证候表现是果，由机体病变所产生，病因是病机变化之缘由，三者之间有着必然性的联系。通过分析证候，就可认识和掌握疾病的本质和原因。病因不同，所致疾病的证候表现亦不同，故可根据证候表现推求其因。此外，运用辨证求因还应结合时令气候、情志变化和体质因素进行全面分析，有一些较为复杂的疾病会出现本质与征象不相一致的表现，此时更应详细诊察辨证，识别虚实真假，才能求得真实的病机和病因所在。