《生物工程学报》创刊于1985年，是由中国科学院主管，由
中国科学院微生物研究所和
中国微生物学会主办的学术期刊。
《生物工程学报》设有综述、动物及兽医生物技术、海洋生物技术、环境生物技术、工业生物技术、农业生物技术、食品生物技术、系统生物技术、医学与免疫生物技术、组织工程与细胞培养、生物技术与方法、科学进展/名家论坛等栏目。
编委：
白凤武、刘德华、单卫星、袁其朋、陈洪章、刘天罡、邵蔚蓝、岳国君、陈坚、刘文军、施一、张杰、陈林、刘湘涛、司书毅、张志芳、陈晓英、刘玉乐、唐鸿志、赵学明、邓初夏、刘志培、
唐双焱、赵宗保、丁铲、娄春波、陶勇、郑海学、堵国成、逯光文、田季德、郑平、方福德、吕雪峰、田志喜、郑世军、高友鹤、马旅雁、王骏、周春燕、姜里文、马延和、
王钦宏、周集中、姜岷、孟颂东、王彦昶、
周继勇、蒋建东、裴雪涛、肖亚中、周景文、金城、彭景楩、谢建平、周琪、景蕊莲、祁庆生、邢建民、朱宝利、孔建强、钱前、邢新会、朱敦明、李大伟、钱韦、荀鲁盈、朱旭东、李猛、秦卓明、杨立荣、朱阳、李银心、邱金龙、杨晟、庄英萍、李震、仇华吉、杨晓
据2018年3月中国知网显示，《生物工程学报》被CA化学文摘（美）（2014）、JST日本科学技术振兴机构数据库（日）（2013）、Pж（AJ)）文摘杂志（俄）（2014）、CSCD 中国科学引文数据库来源期刊（2017-2018年度）（含扩展版）等收录。
据2018年3月中国知网显示，《生物工程学报》总下载1143314次、总被引54361次、（2017版）复合影响因子为0.977、（2017版）综合影响因子为0.587。
推动生命技术发展和促进国家经济建设，及时报道中国国内生物工程方面的重要研究成果，促进国内在这一领域的学术交流，为科研教学和经济建设发挥积极的作用。办高质量的学术期刊。