甘肃农业大学动物医学院是甘肃农业大学下设的二级学院。

1946年，教育部在西北创设兽医学院，在兰州大学先行招生。同年10月，召开国立兽医学院成立大会，宣布国立兽医学院正式诞生，并确定10月1日为院庆日。

1947年10与1日，经教育部批准，国立兽医学院从兰州大学迁出，开始在兰州小西湖新院址独立办学。

1950年2月，西北军正委员会决定，撤消国立西北农业专科学校，将其畜牧科、草原科并入国立兽医学院。学院随即设畜牧系，扩大成为畜牧系和兽医系。12月，经西北军政委员会决定，国立兽医学院改名为西北兽医学院。

1951年，奉西北军政委员会命令，将西北兽医学院改为西北畜牧兽医学院。

1952年9月30日，西北教育部正式下达西北地区高等院校调整方案。经政务院批准，将西北农学院畜牧兽医系并入西北畜牧兽医学院。

1952年10月，西北农学院畜牧兽医系正式合并到西北畜牧兽医学院。

1955年，甘肃省委决定将西北畜牧兽医学院迁往河西。经勘察选址，决定在武威黄羊镇建校。

1958年7月，在黄羊镇校舍基建尚未完成过半的情况下，甘肃省委限期将西北畜牧兽医学院迁到武威黄羊镇，与此同时，将正在筹建的甘肃农学院与西北畜牧兽医学院合并，组建甘肃农业大学，保留原兽医系。

1980年，省委常委决定，同意将甘肃农业大学迁回兰州办学。

1992年，成立甘肃农业大学畜牧兽医学院，下设畜牧系和兽医系。

1993年，兽医系更名为动物医学系。

截至2020年3月，学院开设动物医学、动物医学（兽医公共卫生）、动物药学3个本科专业。

截至2020年3月，学院有教授、研究员18人，副教授（含副高级职称人员）17人，讲师（实验师）10人，助教1人；博士生导师19人（含校外兼职导师9人），硕士生导师48人（含校外兼职导师20人）；有国务院学位委员会学科评议组成员1人，教育部动物医学教育教学指导委员会委员1人，国家“百千万人才工程”第一、二层次人选2人，甘肃省“333”科技人才和“555”创新人才工程第一、二层次人选6人，甘肃省“领军人才”第一层次人选3人，甘肃省“高校跨世纪学科带头人”6人，甘肃省“飞天学者”特聘教授1人；有全国“优秀教师”1人，甘肃省“教学名师”1人，甘肃省“师德标兵”3人，甘肃省“技术标兵”1人。骨干教师中80%以上具有博士学位，有国家级“教学团队”1个，省级“教学团队”1个。

国家“百千万人才工程”第一、二层次人选：赵兴绪、余四九

全国优秀教师：崔燕

甘肃省青年教师成才奖获得者：赵兴绪、余四九、吴润、王雯慧、李晓明、魏彦明、曾巧英

甘肃省优秀教师：杨孝朴

甘肃省教学名师：崔燕、王雯慧

甘肃省“领军人才”第一层次人选：赵兴绪、余四九、崔燕

截至2020年3月，学院有国家级高等学校特色专业1个，国家级卓越农林人才培养计划1个，国家级高等学校本科专业综合改革试点1个，省级教学示范中心1个，有实验室5600平方米，万元以上仪器设备130多台（套），标本5000余件，仪器设备总价值1870多万元；有1所教学动物医院，有18个实践教学基地，有国家级“精品资源共享课”1门、省级精品课程6门。

国家级高等学校特色专业：动物医学

国家级卓越农林人才培养计划：动物医学

国家级高等学校本科专业综合改革试点：动物医学

省级教学示范中心：甘肃省动物医学类实验教学示范中心

截至2020年3月，学院获得1项国家级教学成果二等奖和2项省级教学成果一等奖。

截至2020年3月，学院有博士后科研流动站1个，一级学科博士点1个、，二级学科博士点4个，专业博士学位授权类别1个，一级学科硕士点1个，二级学科硕士点4个，专业硕士学位授权类别1个，省级重点学科1个。

博士后科研流动站：兽医学

一级学科博士点：兽医学

二级学科博士点：基础兽医学、预防兽医学、临床兽医学、动物医学工程

专业博士学位授权类别：兽医

一级学科硕士点：兽医学

二级学科硕士点：基础兽医学、预防兽医学、临床兽医学、动物医学工程

专业硕士学位授权类别：兽医

省级重点学科：兽医学

截至2020年3月，学院有1个省级重点工程研究中心（甘肃省牛羊胚胎工程技术研究中心）。

截至2020年3月，学院“十二五”以来，承担国家科技支撑计划、国家自然科学基金、公益性行业（农业）科研专项和甘肃省重大专项等项目30余项，获省部级以上科技奖励6项，发表科研论文474篇，其中SCI收录200余篇。

根据2022年2月学院官网信息显示，学院组织学生赴白银市会宁县开展“红色之旅，逐梦甘农”党史学习教育暑期社会实践活动，举办第二届甘肃省大学生就业创业大赛。

尚永丰、陈化兰、王玉琳、陈文贤、崔胜、王建林、郑世民、张敬仁、张永光、刘宗平、赵海燕、王晓举、赵启祖、宗瑞谦、付宝全、张乾义、张世珍、张合成、李文卿、李旺泽、位志荣、张效林、沈国伟、陈亚民、曹广益、李琳兴、张生存、卢繁