瓦亚加河是
马拉尼翁河（
亚马逊河支流）最重要的支流，发源自
秘鲁中部
安第斯山脉，流向东北，出峡谷进入亚马逊河盆地，与马拉尼翁(Maranon)河汇流，河道全长300英哩（480公里），阔度40米至100米。瓦亚加河全程都是洪流，流经一系列的
峡谷，有42个急流，河谷两岸种满
可可豆。
瓦亚加河的长度有700英里（1100公里），但是它大部分河段不能通航，仅下游48公里(30哩)段可通大船。。瓦亚加河几乎整个河流都是在高山峻岭中穿行，它穿越安第斯山脉并有有四十二个险滩，还形成了彭哥阿吉雷峡谷。从亚马逊河140英里（230公里）处，可以坐较大的船到从瓦亚加河逆流而上一直到尤里马瓜斯的港口城市：洛雷托。 提升较大的瓦亚加河船（lanchas）到尤里马瓜斯的港口城市：洛雷托。
瓦亚加河没有明确的边界，河流一般分为两到三段。从圣马丁的Tocache（托卡切）镇到河的源头，一般称为瓦亚加河上游，从Tocache（托卡切）或Juanjuii到Chazuta通常认为是瓦亚加河中游，从Chazuta到Yurimaguas（尤里马瓜斯）则是瓦亚加河下游。
在瓦亚加河有着无数的野生动物和植被，两栖生物特别丰富，已有18种青蛙被记录，包括股Prostherapis femoralis, Phyllodromus pulchellus and Dendrobates reticulatus（稀有青蛙种类）。
瓦亚加河从
海拔5700m的源头降至瓦鲁科的1600m，落差巨大，水能资源极为丰富。自70年代以来，对瓦鲁科至廷戈玛丽亚这一段河流的水电资源进行了查勘与研究，1986年完成了在瓦鲁科下游30km处兴建查格亚(Chaglla)
水电站的可行性研究。该电站将建一座高145m，坝顶长240m的混凝土面板堆石坝，由一条长21km、直径为14m的引水隧洞引水发电，发电总水头835m，安装4台单机容量为10.5万kW的斗叶式水轮机，总装机容量为42万kW，年发电量29.85亿kW·h。大坝所形成的水库正常蓄水位1746m，总库容0.6亿立方米，有效库容0.45亿立方米。该工程预计于2000年并网发电。
在初设过程中，曾研究—厂将马拉尼翁河部分径流引入瓦亚加河上游的方案，即考虑兴建依格拉斯(Higueras)水电站，可使查格亚水电站的装机容量从42万
kW增加到135.5万kW，年发电量从29.85亿kW·h增力口到87．6亿kW·h。
自上世纪80年代，在瓦亚加河就已经有种植和贩毒的活动存在。可口被运往哥伦比亚，在那里被用来制造可卡因，随后被运往美国。秘鲁情报部门前负责人蒙特西诺斯的报告中支出，每架满载毒品获准离开瓦亚加山飞机能够获得50000美元的收益。
2012年09月秘鲁政府确认，当地一个
锌矿泄漏出的重金属废水日前流进了亚马逊河支流的瓦亚加河，污染了至少9.7公里的河道。
秘鲁环境部门指出，由于事发锌矿储存废水的井底部的阀门出现故障，含有重金属的废水上周三流入了瓦亚加河，至于有多少废水泄漏，现今仍未确定。事发的锌矿由一家巴西公司所有，而锌矿2011年就获得了秘鲁政府的批准，可在废水中抽取水银、镉、铅、铁及锰等金属，并把经处理的废水排进瓦亚加河。据秘鲁环境部长普尔加·比达尔表示，当局会为此作出非常严厉的惩罚。