正德四年（1509），升任吏部验封司
员外郎。历任吏部稽勋司
郎中。王尚綗在吏部，
藻鉴清明，评定人物“贤者即毁不得，而夺其美；不肖者即誉不得，而益其能”。
嘉靖初年，
明世宗搜访
遗逸，任命他为
陕西左参政，王尚綗不得已而上任。升任
浙江右
布政使。一年以后，卒于任上，享年五十四岁，建祠于苍山之麓来祭祀他。
王尚絅信奉
程朱理学。程朱理学是以理或天理作为世界的本原，认为天地万物都是理派生出来的，理是生物之本，理即形而上的道。王尚絅的可贵之处在于，他不仅尊崇理学，更重要的是能够在
二程理论的基础上，构建并形成自己的哲学体系。一方面王尚絅维护二程的哲学思想，另一方面又将这一哲学体系发展壮大。他的研究成果是明中叶“气本论”理论体系的重要组成部分。王尚絅认为：气决定风的形成和变化，是阴阳二气的相互作用才产生世界万物；气的不同运动形式是构成事物变化的基础。对立气的矛盾运动引起事物变化的哲学观点，揭示了事物发展的规律。