学校以历史悠久、师优教严、人才辈出名闻遐迩。曾二次任浙江省巡抚的兵部侍郎都察院都御史阮元著文《镇海县新建灵山书院记》以彰其造福桑梓之举：“好善行义有不止于此者，周礼六德曰忠和，六行曰任恤。”“左右池水环带，佳木修植，规模完善。”全文由翰林院编修梁同书书写刻有石碑一方，此碑现陈列于校史室内。
光绪二十六年（1900）后学堂浙兴，不久，科举废除，书院改为小学堂。1905年，灵山书院改名灵山学堂。1907年，更名灵山高等小学堂，附设初等小学堂。民国元年（1912），学堂改称学校，1913年，灵山学堂更称灵山高等小学校。1925年，更名灵山学校，校名由书院时期学生、曾任清翰林院庶吉士、编修、侍讲、侍读王荣商书写。1941年，镇海县政府接管学校，为县立灵山学校，附设国民学校。1949年5月，镇海解放，镇海县人民政府接管，1951改名镇海县邬隘小学。1956年7月，改办中学，始名镇海县第五初级中学，1958年9月更名宁波市邬隘初级中学，1985年10月，更名滨海区邬隘中学，1987年8月更名为北仑区邬隘中学。2004年10月，学校隆重举行灵山学校复名暨建校200周年校庆，复名为灵山学校。