澳门同知是乾隆皇帝任命的专门管理澳门事务的正式官员。首任澳门同知印光任，不仅为政清廉，多有建树，而且颇富才华，诗写得也很好，著名诗人袁牧曾为之写传。

澳门同知，全称广州府澳门海防军民同知，清代负责管理澳门洋人，及番禺、东莞、顺德、香山海防的正五品官员。从1744年（乾隆九年）至1911年（宣统三年），共64任。

1743年，因署两广总督策楞、广东按察使潘恩矩等奏请“澳门尤洋人聚居之地，又临近广州，海洋出入，防范不可不周，现仅驻县丞一员，职分卑微，不足以弹压”。清政府改“广东肇庆府同知”为“广州府澳门海防军民同知”，在前山寨设立广州府海防军民同知署，负责稽查出入海船，兼管澳门洋人，归广州府管辖。又将香山县县丞移至澳门望厦村，归澳门同知管辖，再依照理瑶同知之例，给与把总二员，兵丁一百名，在香山、虎门两协内各半抽拨，并酌拨巡缉船只，添建衙署营房，铸给澳门同知“广州府海防同知关防”。1744年，印光任成为首任澳门同知。

1845年11月20日，葡萄牙女王玛莉亚二世宣布澳门为自由港，任命亚马留为第79任澳门总督。1849年，亚马留封闭粤海关澳门关部行台、迫迁香山县丞衙署离澳，澳门同知已无法实际管治澳门。1887年，中葡签订《中葡和好通商条约》，清政府承认葡萄牙管理澳门。

1849年以前，澳葡当局受澳门同知管辖，澳门同知职权较重，其职责包括：限制澳萄居住范围、审理澳门案件、处理澳门贸易、接待传教士往来、守卫澳门，抵抗入侵，打击海盗等。1849年后，澳门同知无法管治澳门，多由七品以下官员署任同知一职，负责向澳葡交涉，阻止澳葡扩界。