从县城出发，沿着清红路往西南走大约3公里，就来到清华古洞，昆畹公路从古洞旁通过交通十分便利。佛教喻“清华”为极乐胜地，此洞清幽，故名。

清华洞是祥云县发现的最早的人类居住遗址之一，为滇西5000年新石器人类文明的典型洞穴遗址，素有“滇西第一洞”之称。清华洞属喀斯特地形石岩溶洞，洞分前洞、后洞。前洞深、宽约30余米，高5米；后洞分二支，深不可测，洞内石花、石笋、石柱甚多，琳琅满目。前洞口右侧顶穹正中，仰视见尺余椭圆形亮光通山顶，称“碟大天”。右侧有小洞3个，时宽、时窄，洞壁大洞套小洞数十个。前洞中主洞位于洞口正中。洞内怪峰突兀、石笋倒挂、悬崖滴乳、落水有声。洞口壁上方有摩岩石刻，计24块，多为明代以来的宫吏及骚人墨客所作。

明朝大旅行家徐霞客两次临洞考察，李元阳、郭松年、杨慎等历代官宦、墨客多次游此并留下摩崖题刻“清华洞天”、“坐卧烟云”、“别有洞天”等。1961年，经考古发掘清理，出土了新石器遗物多件，有梯形石斧、石凿，长条形及月形石刀、石锛等。1988年5月27日，大理州人民政府公布为第一批州级重点文物保护单位。

有关石孔，当地还流传着一个神话故事，传说当年孙悟空赶鲤鱼精进清华洞，洞中一片漆黑，于是悟空便用金箍棒朝洞顶戳了一个窟窿，透出一道光柱，这便是“碟大天”的由来。