据
中国知网收录信息显示，1982年出版发行两期；1983年、1984年各出版发行一期；1985—1987年，为半年刊；1987年01期开始改名为《济宁医学院学报》；1988年01期开始改为季刊。
据2018年4月
中国知网显示，《济宁医学院学报》总被下载286708次、总被引9364次、（2017版）复合影响因子为0.428、（2017版）综合影响因子为0.340。
据2018年4月
万方数据知识服务平台显示，《济宁医学院学报》被引量为5841次，下载量为49937次；2015年影响因子为0.51，在全部统计源期刊（6735种）中排第2788名，在大学学报（医药卫生）（114种）中排第91名。