《沈阳药科大学学报》创刊于1957年，是由辽宁省教育厅主管、沈阳药科大学主办的药学类科技期刊。

1957年10月，《沈阳药学院学报》创刊，为不定期刊物，编辑出版工作由学校的科学研究部负责。

1959年，编辑出版改由学校的药物研究所编委会负责。

1963年起，由于“四清”、“文化大革命”等原因停刊10年。

1973年，复刊，学校成立了学报编辑组，负责学报的出版发行工作。

1984年第2期，开始转为中国国内公开发行的季刊，正式组建了学报编辑部。

1987年第2期，学报开始转向中国国内外公开发行；同年中国国内由自办发行改为邮局发行，被国家科委批准为国家级刊物。

2000年，刊期变更为双月刊。

2006年，刊期变更为月刊。

2014年12月，正式入选国家新闻出版广电总局第一批认定学术期刊。

2017年12月，学报第九届编委会成立。

《沈阳药科大学学报》设有药剂、药物化学、药物分析、药理、临床药学、生物药学、中药研究、环境科学、食品药学、药事管理、医疗器械、综述等栏目。

据2018年11月学报官网显示，《沈阳药科大学学报》第九届编委会共有123名编委，其中常务编委12名。

2017年12月，“药学类期刊发展论坛暨庆祝《沈阳药科大学学报》创刊六十周年学术研讨会”在沈阳药科大学召开。

1957年出版了第1期；1959、1961、1962年先后出版了2、3（中药研究专辑）、4期；1973年出版第5期；1974年、1975年、1977年先后出版了6、7、8期；1978年出版9、10期；1979年、1980年出版11、12期；1981—1983年每年出版2期；1984年出版3期。

据2018年11月24日中国知网显示，学报共出版文献5379篇。

据2018年11月24日万方数据知识服务平台显示，1999—2008年收录的刊期共载文1438篇，基金论文257篇。

《沈阳药科大学学报》被美国《化学文摘》（CA）、美国《乌利希期刊指南（网络版）》、《中文核心期刊要目总览（1992年版、1996年版、2004年版、2008年版、2011年版、2014年版、2017年版）》、《中国科学引文数据库》（CSCD）、《中国期刊全文数据库》（CNKI）等收录，是中国科技核心期刊（中国科技论文统计源期刊）、中国科学评价研究中心RCCSE中国核心学术期刊，全文加入中国知网数据库。

据2018年11月24日中国知网显示，学报总被下载1233728次、总被引46160次、（2018版）复合影响因子为0.600、（2018版）综合影响因子为0.434。

据2018年11月24日万方数据知识服务平台显示，学报被引量为19767、下载量为105540；据2015年中国期刊引证报告（扩刊版）来源数据显示，学报影响因子为0.604，在全部统计源期刊（6735种）中排第2332名，在大学学报（医药卫生）、药学（185种）中排第133名。

及时报道沈阳药科大学的科研成果，不断提高编辑质量，努力争取优秀稿源，为发展中国的医药科研事业做出更大的贡献。