江西农业工程职业学院是江西省人民政府举办的一所全日制普通高等学校，是教育部第二批1+X证书制度试点院校、江西省优质专科高等职业院校、农业部现代农业技术培训基地、江西省现代青年农场主培训基地、江西省高级农业技术人员继续教育培训基地。

民国29年（1940年）秋，清江县立农林初级实用职业学校创办，校址阁皂山。

民国30年（1941年）9月，更名为清江县立农艺科初级实用职业学校。

民国32年（1943年），迁大桥程坊村，增办高农，更名为清江县立农业职业学校。

民国37年（1948年），更名为清江县立高级农业职业学校。

1949年，迁大桥槨里；同年5月，并入樟树联合中学，称为农职部。

1950年，与樟树联合中学分开，更名为樟树农业职业学校，隶属南昌专署领导。

1952年9月，更名为江西省樟树中等农业技术学校。

1954年9月，更名为江西省樟树农业学校。

1958年8月，在江西省樟树农业学校基础上，增设南昌专区农业专科学校，实行一套班子，两块牌子办学。

1959年6月，南昌专区改为宜春专区，专区农业合作社干部学校与樟树农校、南昌农专合并，改办江西宜春农学院，保留中专部，设有农作、植保、果蔬、牧医4个专业25个班次，在校生1200余人。

1960年4月，院、校分家，中专部继续在樟树办校，称宜春地区樟树农业学校。

20世纪60年代初，学校停办，教师和干部大部分调往其他单位工作。

1963年7月，恢复江西省樟树农业学校，由江西省农业厅、宜春地委双重领导，先后招收过3年制中专班，1年制“社来社去”农技班和4年制半工半读的学生。

1966年后，学校受到严重破坏，基本处于瘫痪，曾一度划归清江县管。

1968年9月，改为宜春地区樟树农业学校。

1969年（至1976年），学校办短（培）训班，先后办过各种培训班108个，办宜春地区培训农作、种子、植保、旱作、茶果、牧医、水产等技术骨干及农机驾驶、修理人员、社队干部共计4889人次，还为全省开办腐肥培训班，共计培训400余人次；同年8月，更名为宜春地区教育农业学校。

1971年3月，更名为宜春地区樟树农业学校。

1977年12月，由江西省农业厅接管，并更名为江西省樟树农业学校。

1978年，增设江西省农机技工学校。

1980年，恢复中专班招生，被评为江西省重点中等专业学校。

1985年，被批准为江西省樟树农业专科学校，但未招生。

2000年，被确定为国家级重点中等专业学校。

2004年6月，升格为高等职业学院，定名江西农业工程职业学院。

2013年，获批江西省单独招生改革试点。

2014年，成为江西省基层农技人员定向培养学校。

2019年10月，被评为教育部第二批1+X证书制度试点院校。

2020年，被评为江西省优质专科高等职业院校。

2021年，新校区开始建设。同年，经省教育厅批准，与中医药大学联合培养“中药资源与开发”专业本科层次人才。

据2024年5月学校官网数据，学校设有7院2部，开设高职专业36个。

据2024年5月学校官网数据，学校有教职工482人，其中教授30人，副教授42人，省级学科带头人1人，省级教学名师3人，省级中青年骨干教师10人，省级优秀教学团队2个。

据2024年5月学校官网数据，学校有2个省高等学校特色专业；已建成3门省级精品课程，3门省级精品资源共享课；建有国家级园林实训示范基地，中草药实训基地、农机维修实训中心、畜牧兽医实训中心获省财政支持建设项目，拥有82个校内实验实训室和校内教学基地，128个校外实训基地；是国家农业部现代农业技术培训基地、江西省现代青年农场主培训基地、江西省高级农业技术人员继续教育培训基地；设有国家职业技能培训站与鉴定站（批准鉴定初、中、高级25个工种）、全国英语四六级考试考点、全国计算机等级考试考点和全国电子商务师资格考试等考点。

据2024年5月学校官网数据，学校教师参加教师教学能力大赛获全国二等奖二次，三等奖一次；获省级三等奖一次，二等奖二次；学生2021年度参加各级各类职业技能竞赛项目；获得国家级奖励2个、省部级奖励82个，行业赛项奖励13个；学校中药传统技能、鸡新城疫抗体水平测定和蔬菜嫁接参赛团队，多次代表江西省参加全国职业技能竞赛。

2017年至2019年，学校获省级教学成果奖一等奖1项、二等奖4项。

2020年度，学校申报各级各类科研项目（课题）67项，获立项24项，各级各类科研结题项目（课题）21项，在江西省农牧渔业科研课题和江西省中医药管理局科技计划项目等均有立项。

据2024年5月学校官网数据，学校图书馆馆藏图书30万册。截至2008年11月，学校图书馆馆藏1947年以来装订成册的各类期刊合订本21693册，报纸合订本5962册，有清代铜版本《古今图书集成》1581册。

据2023年3月学校官网显示，学校先后与华中农业大学、宜春学院、江西农业大学、中国农业大学等联合办学，与井冈山大学联合培养应用技术型本科人才，与江西中医药大学联合培养“中药资源与开发”专业本科层次人才，与中国农业大学合作开展网络教育，层次有高起专和专升本。主要开设有农学、动物医学、会计、食品质量与安全、工商管理等20多个专业。

截至2021年12月，学校是中国现代农业职业教育集团、中国畜牧业职教集团、中国现代农业装备集团、中国都市农业职教领回副理事长单位，江西林业职教集团成员单位，并与集团企业和学校之间进行合作；与富士康科技集团鸿准公司合作并共同制定人才培养方案，实行“2+0.5+0.5”的教学模式，即学院二年在学院学习，半年参加企业上岗培训，半年顶岗实习。

公、诚、勤、朴

截至2021年12月，学校有学生社团25个，开展了科技文化艺术节、社会实践、职业技能竞赛月、体育运动会、风采主持人大赛等学生活动。