民办高等专科学校，是指民办学校中的高等专科学校，是民办高校的组成部分。

2008年5月8日，教育部发展规划司发布《关于民办本科学校、民办高等专科学校核发民办学校办学许可证的通知》（教发司〔2008〕52号）。《教育部办公厅关于修订换发民办学校办学许可证的通知》下发前教育部批准设立的民办本科学校、民办高等专科学校按照要求，逐一如实填写附表。省级教育行政部门负责本辖区内的民办本科学校、民办高等专科学校的核发办学许可证检查和附表上报工作。核发民办本科学校、民办高等专科学校办学许可证，是贯彻落实《民办教育促进法》及其实施条例、《民办高等学校办学管理若干规定》的重要措施。

2012年，教育部印发了《关于鼓励和引导民间资金进入教育领域 促进民办教育健康发展的实施意见》，对落实民办学校招生自主权做出明确要求，进一步扩大民办本科学校招生自主权，支持民办高校参与高等学校招生改革试点，省级教育行政部门可视生源情况允许民办本科学校调整招生批次；完善民办高等专科学校、高等职业学校自主招生制度，有条件的地区教育行政部门可允许办学规范、管理严格的学校，在核定的办学规模内自主确定招生范围和年度招生计划。