出弥勒殿，过方形天井，拾级而上，是毗卢宝殿。佛像高约5米，连须弥座在内高达8.6米，左右侍立着梵天、帝释两天王，他们是“天龙八部”成员，佛教中的护法神。大殿两庑，分列20座诸天王木雕像，也是“天龙八部”成员，个个点金妆彩，光泽耀眼，造型生动，神态各异，均高2米以上。
毗卢遮那佛背后，是海岛观音群塑，表现的是观音普渡众生的32应身，形态各异，从容自若。海岛中塑造有数十个人物，中央是巨大的南海
观世音菩萨，其左右胁持为善财童子和龙女。大殿前侧左右各有大钟、法鼓一面，大殿后侧有两座雕刻精细、妆金涂彩的大型豪华佛龛，原系北京紫禁城的清朝遗物，于1979年运至栖霞寺，佛龛内分别放有石刻观音像和阿弥陀佛像。石刻阿弥陀佛像头部为寺内收藏的旧物，躯体为南京艺术学院张祥水根据北朝石刻用石膏制作后着色仿旧，该石佛头部长颜广颐，疑为梁朝临川靖惠王萧宏所造无量寿佛石像遗物，石刻观音像头部较小，疑为唐代遗物。