毒素武器，toxin weapon，用于敌对目的的毒素。是由细菌、动物、植物和真菌等生物产生的有毒化学物质。其毒性极大，可直接使人畜产生伤害或死亡。

亦称毒素战剂(toxin warfare agent)。

早期人们曾把毒素归类或误认为生物武器，但它与生物武器有本质的不同，它不是活性的生物，而是生物的特殊代谢物或分泌物，应属于化学武器(化学战剂)的范畴。

与化学战剂一样，不论是来源于生物，还是化学合成，本身都是无生命和不会繁殖、传染的化学物质。由于它们处于生物科学和化学科学的重叠交叉的边缘，故又称生物化学武器(biochemical weapon)。

毒素武器的特点是：(1)毒性超群，其致死性比最毒的神经性毒剂大数百倍至万倍，无防护人员吸入或吸收微量即可死亡或失去战斗力。可使具有良好战斗防护装备的部队降低战斗力15%～20%；(2)不同作用机理、难侦、难治，它们不抑制酶系统，而是直接作用于特殊细胞的受体，用已知的侦检方法难以识别；(3)不同于生物武器，毒素武器虽和生物武器同属生物源战剂，来源于生物，但有质的区别，前者是生物产生的化学物质，后者是活的、具有传染性的生物；(4)与天然毒素关系密切，但不相同。

化学防护器材能有效地对其防护。