用人工的方法，从不同生物中提取外源基因片段及载体DNA，经过体外切割、拼接和重组，然后采取某种方法，把重组后的带有外源基因的载体DNA引入植物细胞，并使其在植物细胞内进行复制和表达，以达到预期的改变受体植物细胞遗传特性的目的·此种过程即称为植物基因工程

中心以植物基因组学国家重点实验室为基础组建。研究队伍中具有中国科学院院士1名，基金委“优秀创新群体”2个（入选者6名），国家杰出青年基金获得者7名，中科院“百人计划”入选者8名，中科院“创新团队国际合作伙伴计划”入选者5名。中心面向国家战略需求与科学发展前沿，瞄准植物基因组学研究的发展趋势，以基因组的结构研究为出发点，系统、深入地开展植物功能基因组学研究，着重于大规模新基因的克隆鉴定、功能分析和潜在应用价值的探索，力求阐明调控重要农艺性状的分子遗传机理与网络，推动植物生物技术的源头创新和转基因植物的产业化。中心力求建设具有国际水准的创新研究群体和技术平台，以形成具有国际影响的植物基因研究中心

植物基因工程技术就是先将特定的目的基因分离，然后利用载体、媒体或其它的物理、化学方法将分离的目的基因导入植物细胞受体，并整合到植物受体细胞的染色体(基因的载体)上，从而获得目的基因在植物受体中的表达，最终达到改变植物性状（如抗并抗虫、抗逆等）以及快速培育植物新品种的目的。植物基因工程技术不仅在于通过与常规育种技术的结合，在培育优质、高产和抗逆植物新品种中具有巨大潜力，而且它还是植物分子生物学基础研究的极好手段。