1992年，由其创作的散文《妈妈的手臂》入选《1992年度全国中小学生精短散文集》；同年，由其创作的散文《真爱》入选《1993年度全国中小学生精短散文集》。1993年，被学校推荐为中国青少年名人，收入共青团中央编撰的图书《中国青少年年鉴》。1994年，出版散文集《十七岁不哭》；同年，创作散文集《我把青春献给你》。
1998年，担任校园青春剧《十七岁不哭》的编剧，该剧改编自她的同名散文集，讲述了一群十六七岁男孩女孩的青春成长故事。2001年，担任剧情电影《
横竖横》的制作人，该片由
王光利执导。2007年11月，由其创作的电影文学剧本《分开我们就坠落》在日本东京获得亚洲青年剧本奖。
2009年，执导个人首部电影《
80'后》，影片描绘了一个失去亲人的少女为了获得爱情和事业的成功，努力打拼的故事，入围第14届中国电影华表奖优秀影片奖、第22届东京国际电影节主竞赛单元-东方电影节大奖。2018年1月12日，由其自编自导的剧情电影《
无问西东》上映，该片由
章子怡、
黄晓明等联合主演，获得第10届澳门国际电影节金莲花评委会大奖，她凭借该片入围第34届大众电影百花奖最佳导演奖、最佳编剧奖。
李芳芳有一种君子气概和强大的信念，她也没在逞强，她信她做的事情。在电影《无问西东》中，她在故事细节的处理上多处主打感性的力量，这对女性观众和部分男性观众的情感无疑是十足的“杀手锏”（独立撰稿人吕彦妮、中国新闻网综合评）。
对李芳芳来说，调度的贫瘠，剪辑上的创意单薄，符号的直白功能、配乐的杂乱无章都随处可见。虽然是专业出身，在不少细处能看到相对扎实的亮点，但从整体而言，她缺乏一个大的统合能力。她对历史叙事，甚至是对电影本身的意识，都是女性文学化的直觉所铺展出来的。她或许是一个有文艺追求的导演，也是一个有动情力的导演，但论艺术功力，她还远远不够成熟。在一个以个性商业片为荣的时代，李芳芳已经算是一个异类了（新浪娱乐评）。