这座亭阁原是宋右丞相
贾似道为其父抗金名臣魏国公
贾涉暮年观瀑而建。传说此亭建成时，贾似道请高僧妙宏命名。妙宏认为贾似道依仗其姐贾妃得宠理宗，虽位极人臣，威慑朝野，赫赫然不可一世，但弄权误国，善恶有果，只不过是昙花一现的人物罢了。于是给它取名为“昙花亭”。
当贾似道问他命名之意时，妙宏故说：此亭落成时，贫僧给罗汉供茶，茶瓯即现朵朵昙花，色彩璨然，并示“大士供应”四字，故取此名。贾似道信以为真，就以“昙花亭”书匾名之，欣欣然自以为乐。不久，贾似道果然削职，被郑虎臣杀于押解路上——漳洲木绵庵（今福建龙溪县），成为“昙花一现”的人物。妙宏慧眼识奸相，巧名“昙花亭”就成为佳话留传至今。
清道光年间，昙花亭倒坏重建，曾改名为“雨来亭”，太傅
潘世恩（吴县人）还为雨来亭增撰了一副对联：“甘雨时霖，亭成志喜；嘉禾善养，岁庆占丰。”但由于习惯，人们仍以“昙花亭”称之。
1981年，政府拨款重修，为尊重历史，又还名为“昙花亭”。现在它与“石梁雪瀑”、中下
方广寺、五百罗汉铜殿和“铜壹滴漏”，已成为
石梁景区的主要胜景。