日本学术会议（日语：日本学术会议/にほんがくじゅつかいぎ、英语：Science Council of Japan），是属于日本内阁府的特别机关。

从日本约820名科学家与2000名的连携会员中，选出210名会员组成大会，任期三年。设会长一名，副会长二名。总会下设七部，六个常设委员会、运营审议会及八个临时（特别）委员会，并另有事务局。总会是日本学术会议的最高决策机构，通常一年中召开春秋两次会议。组织中的部是机构的核心，按照综合大学的七个学部（文、法、经、理、工、农、医）设立。

常设委员会分为六个，针对以下事项进行审议研究：

日本学术会议具有审议功能和研究联络功能。另外，政府亦可向日本学术会议提出咨询要求，日本学术会议则需提出审议报告，也可主动地针对问题提出报告。至第13届日本学术会议为止，该组织共提出各种建议报告共680件。

作为代表日本科学界的机构、促进研究人员之间的国际合作、进行信息传播和信息收集、并反映科学家对政策的意见。

根据这一目的，为了维持学术会议与各团体之间的紧密合作关系，对于协力学术研究团体进行认证，并提供信息和赞助。并且，提升科学之进步与发展，使科学能深植到行政、产业及国民生活之中。

第20届会议

平成18年（2006年）10月1日至平成20年（2008年）9月30日。

第21届会议

平成20年（2008年）10月1日至平成22年（2010年）9月30日。

第22届会议

平成23年（2011年）10月1日至今