该书按四部分类法编目，对撕裂为数卷的同一文献进行了合并校录，并尽可能为所收载的每一个卷子确定了适当的标题。另外，每一个校录文本都附解题，简要说明底本和参校本，原件完缺情况、定名依据、年代判断、内容、文献存佚及前人著录研究情况。
《敦煌经部文献合集(繁体纵排版)(套装全11册)》主要内容：敦煌文献的发现，是世界文化史上的一件大事。多达六万件左右的古代写本、刻本，聚集了公元4至11世纪古代历史文化的无尽宝藏，迅速形成了一门引领20世纪学术潮流的国际显学——
敦煌学。
但在20世纪80年代之前，由于种种原因，敦煌学是“吾国学术之伤心史”，以致有“敦煌在中国，研究在外国”的说法。20世纪80年代以后，我国敦煌学界发奋图强，后先相继，成果丰硕，局面已大为改观。但仍缺乏集大成的著作问世。汇辑出版一部集大成的高质量的敦煌文献总集，真正昂首自立于世界敦煌学著作之林，是我国学术界几代人的心愿，是“古籍史上前无古人”的伟业。正是在这种背景下，20世纪90年代，以张涌泉为首的一批年轻的敦煌学家开始了《敦煌文献合集》的编撰工作。
《敦煌文献合集》是将敦煌文献（汉文翻译佛经以外部分）按传统的四部分类法整理编排。整理工作包括定名、题解、录文、校勘等项。目的是为学术界提供一部校录精准、查阅方便的敦煌文献的排印本。使其成为像标点本二十四史那样的“定本”，使敦煌文献成为各个学科都可以使用的材料。经过十多年的艰苦努力，这项敦煌学集大成的跨世纪工程的第一部分成果——《敦煌经部文献合集》终于面世了！
《敦煌经部文献合集》通过对现已公布的所有敦煌经部文献的全面普查，在分类、汇聚、定名、缀合、汇校等工作的基础之上，把所有相关写卷及其校录成果全部类聚在了一起，使之成为名副其实的敦煌文献整理研究的集大成之作。在类聚的基础上，又融进了编撰者自己的许多研究心得，多发前人之未发，显示出了编撰者广博的学养和敏锐的学术洞察力，使《敦煌经部文献合集(繁体纵排版)(套装全11册)》达到了敦煌文献整理研究的最新学术水准。
《敦煌经部文献合集》分为“群经类”、“小学类”两大部分。“群经类”包含《
周易》、《尚书》、《诗经》、《礼记》、《左传》、《谷梁传》、《论语》、《孝经》、《尔雅》九经；“小学类”包含韵书、训诂、字书、群书音义、佛经音义五类。书末附有卷号索引，方便读者检索查阅。