提前还款风险与提前还款引起的抵押贷款的现金流变化有关的风险。即投资者担心借款人会在市场利率低于抵押贷款利率时提前还款。例如，某抵押贷款的利率是8%,贷款于5年前发放，市场利率是5.5%，此时借款人就会有动机进行再融资。再融资主要取决于贷款利率与市场利率的区别。投资者的损失是，借款人还款的金额只能以低于原抵押贷款的利率再投资。

抵押贷款组合(mortgage portfolio)是支持按揭证券(MBS)的资产，MBS持有人获得的利息与收回的本金来自这个资产组合。提前偿付意味着MBS所依赖的贷款资产减少，收回的现金可能无法获得比MBS更好的回报。因此，虽然MBS发行时即已考虑了提前偿付的风险，若提前还款的速度较预期为快，MBS的价格通常会下跌。