心血管疾病国家重点实验室于2011年经科技部批准立项筹建，是我国第一个心血管疾病研究领域的国家重点实验室，是心血管疾病基础和转化医学重要的开放性研究基地。

心血管疾病国家重点实验室依托单位为国家心血管病中心、中国医学科学院阜外心血管病医院。

现有科研和技术人员49人。其中中国工程院院士4人，国家“973”首席科学家1人，国家自然科学基金杰出青年基金获得者3人，教育部创新团队2个，教育部新世纪优秀人才2人，新世纪百千万人才工程国家级人选3人，协和学者“特聘教授”6人，协和学者“讲座教授”1人，协和创新团队3个，具有国际视野和水准的青年科学家20余名。