微孢子门(Microsporidia或Microspora)的寄生虫。主要寄生在昆虫的消化道上皮细胞以及鱼类的皮肤和肌肉中，也见於环节动物和某些其他无脊椎动物体内。感染的特点是病变组织肿大。

微孢子虫(Microsporidium)，有1200多种，是最小个体的寄生原虫，广泛寄生于节肢动物、鸟类、哺乳动物和人类。近年来发现HIV感染者或艾滋病患者常并发感染微孢子虫，是引起HIV感染者或者艾滋病患者腹泻的重要病原体。形态与生活史:微孢子虫期包括孢子、分裂体、母孢子和成孢子，孢子是微孢子虫的感染期。是微孢子虫生活史中唯一可在宿主细胞外生存的发育阶段。成熟的孢子呈圆形或椭圆形，长2.0～3.0“m，宽1.5—5.01xm。成熟的孢子含有极管(polar tube)，亦称极丝(polar filament)。

极管螺旋状从孢子前端的固定盘(anchoring)连至虫体末端，并缠绕胞核，后端有一空泡。极管的螺旋数依不同属的微孢子虫而异。成熟孢子经口摄被宿主吞食后，孢子内的极管伸出，刺入宿主细胞膜，将感染性的孢子质(sporoplasm)注入宿主细胞而感染。虫体二分裂或多分裂方式增殖，经血液循环播散到肝、肾、脑、肌等组织器官，最终转化形成母孢子进入孢子增殖阶段。母孢子在同一细胞内发育并分裂成孢子细胞，最终变形成孢子并可以释放到外界环境中．孢子对外界环境具有较强抵抗力。

微孢子虫（Microsporidium）具有微小的孢子(2～20公忽〔0.00008～0.0008吋〕)，内含单一极丝以及具传染性的孢原质。孢子被新寄主吞食後，虫体进入肠道上皮并经由血液或体腔到达特定组织。在宿主细胞中生长发育并反覆进行无性分裂，每次产生两个或更多的个体。最後，成熟的寄生虫(营养体)经有性生殖产生合子，合子再产生新孢子。蚕微粒子虫(Nosema bombycis)使蚕发生蚕孢子虫病，蜜蜂微粒子虫(N. apis)则在蜜蜂中造成微粒子病。

在HIV感染者或艾滋病患者常发现感染微孢子虫，也是引起HIV感染者或艾滋病患者腹泻的重要病原体。

微孢子虫（Microsporidium）属微孢子门、微孢子目。迄今从人体中至少已发现有5个属的微孢子虫，它们是匹里虫属（Pleistophora）、小孢子虫属（Nosema）、脑炎微孢子虫属（Encephalitozoon）、肠上皮细胞微孢子虫属（Enterocytozoon）和微孢子虫属（Microsporidium）。微孢子虫分布很广，以往已知是一种动物病原体，80年代人们才逐渐认识到它具有感染人的能力,引起微孢子虫病（microsporidiosis）。

其虽是真核生物，但与原核生物极为相似。

成熟孢子为卵圆形，其大小因虫种而异，约为0.8～1×1.2～1.6μm，具折光性，革兰氏染色呈阳性，姬氏或HE染色，着色均较淡，孢子壁光滑。电镜下可见孢子壁由内外两层构成，内壁里面有一极薄的胞膜，细胞核位于中后部，围绕细胞核有一螺旋形极管（或称极丝）。孢子的前端有一固定盘（Anchoring disc）与极管相连，形成一突起，后端有一空泡。孢子母细胞呈香蕉形，一端较尖，一端钝圆，大小为3～5×4～8μm，HE染色，细胞核位于虫体中部呈深紫红色，核与外膜之间有管状物，着色较淡。

消化道微孢子虫感染是由于成熟孢子被吞入后侵入肠壁细胞所致。其它部位的感染则是微孢子虫经消化道进入人体后，通过血循环而到达不同部位。当孢子受到刺激后，其极管伸出，刺入邻近细胞，将其有感染性的孢子质注入新的宿主细胞而使其感染。随着其在宿主细胞内生长、增殖，逐渐向周围细胞扩散或经血循环播散至肝、肾、脑、肌肉等其它组织器官。

不同的微孢子虫的发育周期虽有不同，但都由裂体增殖开始并扩散到其它细胞，然后是孢子增殖，且都在同一宿主体内进行。一般3～5天为一周期，无有性生殖期。有些微孢子虫是在宿主细胞胞浆中的纳虫空泡内生长繁殖，有的则直接在宿主细胞胞浆中生长。