山东棉花研究中心是在原山东省棉花研究所（1959年建立，向前可追溯至1918年山东省立棉业试验场）的基础上，于1986年由
联合国开发计划署援建的综合性棉花专业科研单位，隶属于
山东省农业科学院。现有在职职工140人，其中科技人员80人，副研以上高级技术职务人员31人，中级技术职务人员33人，有博士6人，硕士15人。
棉花中心下设遗传育种研究室、栽培研究室、植保研究室、行政办公室、科研办公室、技术推广科和临清试验站，控股山东鲁壹棉业科技有限责任公司和临清鲁壹种业有限公司。主要从事棉花遗传育种、生物技术、种质资源、栽培生理、土壤农化、植物保护、科技成果开发与技术服务等工作。
自建所近五十年来，共取得科研成果50余项，其中获省部级以上奖励的39项。在遗传育种方面，先后培育出了鲁棉1号等近30个优良棉花品种(系)。其中鲁棉1号以其高产、稳产、抗逆性强、适应性广的优良特性，在全国曾累计种植过亿亩，创直接经济效益超过57亿元，荣获国家发明一等奖；近年来，将技术与常规育种技术相结合，在转基因抗虫育种研究方面又取得了重大研究进展，培育出抗虫杂交棉、常规抗虫棉、短季抗虫棉
鲁棉研15号至
鲁棉研38号三大类型24个系列抗虫棉花新品种，先后通过了国家和（或）省级审定，这些棉花新品种均表现高产、优质、抗病、高抗棉铃虫，推广应用面积占全省棉花总面积的80%以上。2008年，鲁棉研15、19、21和28号同时被选为国家黄河流域4个不同类型棉花品种区域试验的对照品种。2006~2009年，
鲁棉研21号、
鲁棉研28号山东棉花研究中心是山东省棉花专业研究单位，也是国内规模最大、实力棉花专业科研机构之一，拥有
山东省棉花栽培生理重点实验室，是国家棉花改良中心山东分中心建设项目依托单位。具有较强的科研力量，先进的仪器设备，良好的科研条件，研究基础和技术储备。现有高标准试验地500亩，实验室等建筑物面积共计1.5万多平方米，仪器设备价值1000多万元，有万元以上大中型仪器设备达80多台（件）。现建有5个实验室：①栽培生理实验室(山东省重点实验室)：主要研究棉花光合生理、抗逆生理和棉花高产优质栽培技术。②遗传育种实验室：主要进行棉花种质资源研究，选育中早熟、短季棉和杂交棉花新品种。③分子生物学实验室：是国家棉花改良分中心重点资助建成的实验室。主要研究棉花分子标记育种、遗传转化和种质创新。④植物保护实验室：研究棉花病虫草害发生规律和综合防治技术，开展棉花抗病、抗虫鉴定。⑤棉花种子生理实验室：主要研究棉花种子储藏、加工技术，进行种子质量检验。