小核RNA,也见译为核内小RNA(常见缩写为snRNA,是英文small nuclear RNA的简写)是含有100到300
碱基的RNA。
snRNA参与
真核生物细胞核中
RNA的加工。snRNA和许多
蛋白质结合在一起成为小核
核糖核蛋白(snRNP即small nuclear ribonucleoproteins),参与信使RNA前体(pre-mRNA)的剪接,使后者成为成熟
mRNA。
真核细胞有
细胞核和细胞浆中都含有许多小RNA,它们约有100到300个碱基,每个细胞中可含有105-106个这种RNA分子。它们是由RNA聚合酶Ⅱ或Ⅲ所合成的,其中某些像
mRNA一样可被加帽。在细胞核中的小RNA称为snRNA,而在细胞浆中的称为
scRNA。但在天然状态下它们均与
蛋白质相结合,结合物分别称为snRNP和scRNP。某些snRNPs和剪接作用有密切关系。有些snRNPs分别和供体及受体剪接位点以及分支顺序相互补。snRNAs中最受注意的一个是U1,它普遍存在于哺乳动物、鸟类和昆虫细胞中。人U1snRNP中除RNA外还8个蛋白质分子。其5'端的11个
核苷酸是单链的,并有一段和内含子左侧的供体序列互补。在供体位点处的互补序列通常为4-6bp。在体外,完整的U1snRNP粒子能和左侧共同顺序结合,但纯化的U1snRNA却不能。U1snRNA参与剪接的证据是抗U1snRNP的抗体可以在体外抑制剪接作用;而且如果从系统中将U1snRNP除去,剪接即不能进行。事实上,除去U1sn RNA5'端的几个
核苷酸即可抑制体外剪接作用。
有可能U5snRNA能识别右侧(受体位点)共同顺序;而U2snRNA,则具有与分支位点互补的顺序。抗U2snRNP的抗体可以和U2snRNA及包括分支位点在内的内含子所形成的复合体发生免疫沉淀。U1和U2可能参与剪接反应的起始阶段,因为U1和U2的灭活将阻止左侧连接点的切断和套索的形成。另外两个snRNAsns(U4和U6)可能亦参与剪接作用,但它们的功能尚不详。一般认为,脊椎动物细胞有6种不同的snRNAs,称为U1、U2、U3、U4、U5和U6。最小的是U6,有约100核苷酸长。最大的是U3,也不过215核苷酸长。它们和蛋白质结合成snRNPs。系统性红斑狼疮(SLE)患者和某些风湿病患者的血清中常可检出对snRNPs中某些蛋白质的自身抗抗体。