西藏察隅慈巴沟国家级自然保护区位于西藏自治区察隅县中部，地理坐标为北纬28°34′~29°07′，东经96°52~97°10′。森林生态系统类型自然保护区。保护区总面积为101400公顷。西藏察隅慈巴沟国家级自然保护区成立于1985年，2002年晋升为国家级自然保护区。主要保护对象：扭角羚、羚牛及栖息地生态系统。

1985年，西藏察隅慈巴沟自然保护区成立。

2002年，西藏察隅慈巴沟自然保护区晋升为国家级自然保护区。

2023年11月30日，国家林业和草原局公布《陆生野生动物重要栖息地名录（第一批）》，西藏察隅慈巴沟兽类鸟类及昆虫重要栖息地入选。

西藏察隅慈巴沟国家级自然保护区位于西藏自治区林芝地区东南面的察隅县中部，地理坐标为北纬28°34′~29°07′，东经96°52~97°10′。

西藏察隅慈巴沟国家级自然保护区地处青藏高原的东南角，喜玛拉雅山与横断山呈“T”形的交汇处。整个地形地势是北高南低，近似“簸箕”形，迎向印度洋。西藏察隅慈巴沟国家级自然保护区内山地地貌垂直分异明显，高山地带多发育有发达的海洋性冰川，山脊部位由冰川侵蚀形成的角峰、刀脊、冰斗等冰蚀地貌。

西藏察隅慈巴沟国家级自然保护区的土壤主要由山地黄壤、山地黄棕壤、山地棕壤、山地暗棕壤等七个土类组成。

西藏察隅慈巴沟国家级自然保护区内的察隅河是雅鲁藏布江下游布拉马普特拉河的一大支流，大体呈北向南。察隅河上游有东西支流，分别源自两个山脉。西支为贡日嘎布曲，发源于贡日嘎布拉山附近；东支为桑曲，源自于舒拉岭。西藏察隅慈巴沟国家级自然保护区内位于察隅河东西两个支流之间，桑曲北岸，桑曲的支流娄巴曲从北至南贯穿整个区域。

西藏察隅慈巴沟国家级自然保护区气候温暖多雨。该气候区年降水量达1000毫米以上，1000~2500米海拔地区年平均气温10~20度，年平均湿度为60~70%，无霜期200天以上。

西藏察隅慈巴沟国家级自然保护区划为核心区、缓冲区、实验区三个部分。

核心区：面积为53200公顷。范围从格泥山顶—都拉山口—沿沟谷小道至甲瓦弄巴口—沿山脊至甲瓦弄巴东山顶—甲米拉—贡麻山顶—牧苦弄巴北山顶—察东4961山顶—金东拉卡—本格拉—格泥山顶。另外，核心区还包括矢朱村、拉木弄巴两个保护点。

缓冲区：面积为23150公顷，位于核心区和实验区之间。

实验区：面积为25050公顷。位于保护区外围，范围是慈巴沟桥—二十二道班—山脊—莫拉弄巴东北山顶—东沿山脊至慈巴沟—山脊至4781山顶—卡米日—沿山脊至错铁好梁子—慈巴沟桥。甲瓦弄巴两边谷坡及次走弄巴南面谷坡。

羚牛（扭角羚一般指羚牛）：体形粗大，肩高110-120厘米，雄性体重可达400千克，最大者肩高可达2米，重达1吨。羚牛属中国一级保护动物，被中国公布的红皮书列为濒危种。2007年，被列入濒危野生动植物种国际贸易公约附录Ⅱ。2008年，列入《世界自然保护联盟》（IUCN）濒危物种红色名录ver3.1—易危（VU）。

澜沧黄杉（拉丁学名：Pseudotsuga forrestii Craib）中国国家二级保护植物，为松科黄杉属下的一个种，常绿乔木，主枝通常无毛或近无毛，侧枝被短柔毛。

西藏察隅慈巴沟国家级自然保护区同时将讲保护区内亚热带常绿阔叶林、亚高山常绿暗针叶林、云南松林列为重点保护对象。

完善地方法规，根据国家、自治区关于自然保护区管理的法律、法规、条例，制定适合西藏察隅慈巴沟国家级自然保护区管理的地方法规，并公布实行；

划界标桩，将西藏察隅慈巴沟国家级自然保护区的面积和界线落实到实地，用耐用的材料打桩钉牌，以示区别；

实行分区管理，核心区禁止人为活动，包括生产、旅游等均不应在核心区内进行，保护区管理人员因工作需要进入核心区时，必须严格要求自己，妥善处理垃圾，保护好环境；

加强对生态环境和物种的保护，包括严格保护原始的亚热带常绿阔叶林、亚高山常绿暗针叶林，云南松林，以及本区特有的原始云南黄果冷杉、澜沧黄杉群落；

加强对扭角羚等国家重点保护动物及其生存环境保护，以防逃失或进入非保护区；

对保护区的珍惜树种、大树、古树、观赏价值高的树种加强保护，有条件的地方进行挂牌宣传保护；加强对保护区科研工作和保护区人员的培训，将科研成果用到保护管理工作中；设立保护站、保护点、检查站；

建立完善奖惩制度。同时还建立巡逻和护林防火制度、建档制度、宣传教育制度、病虫害防治、社区共管等制度。

阿扎冰川：西藏察隅慈巴沟国家级自然保护区内的阿扎冰川第一阶梯一般作为专业登山队的训练基地。

温泉和冷泉：2004年，受深圳援藏队伍支持在察隅县开设口岸发展边贸，组织开发温泉宾馆增加旅游业收入。

西藏察隅慈巴沟自然保护区对察隅整体生态环境实施的有效保护，将稳定地维持印度洋暖湿气流对高原汽输送线的“畅通无阻”，进而使整个高原东南部与高原内陆的生态环境免受人类活动所造成的影响，保证整个高原东南部森林生态系统的稳定，并为当地社会经济的持续发展创造良好稳定的外部环境。

西藏察隅慈巴沟国家级自然保护区的建立，将其丰富的山地生态系统，生物物种以及其所含众多的遗传基因得以保存与发展，不仅为当地经济可持续发展保存了无比珍贵的生物资源，也为人类社会的可持续发展保存生物种子有着重要意义。

西藏察隅慈巴沟自然保护区在生物、地质、冰川、气候、水利等众多科研领域中占有的特殊地位，是察隅慈巴沟国家级自然保护区建立后将成为重要的科研基地，并为人类进一步深入认识自然规律做出重大贡献。