当时,燕王
朱棣已经南下,姚善密结
镇江、
常州、
嘉兴、
松江四郡守,操练民兵为备。姚善向朝廷推荐钱芹,署行军断事。姚善后至京师,
画策防御,又跟随大将军北行,不久还京。正好朝廷以燕王上书,贬谪
齐泰、
黄子澄于外,姚善进言不当贬官,说:“人有文武才略,可
扶颠济危者,反置
散地不用。今事已狠狈,急须召之,询其名曰:今人才孰有过于黄大卿者”,于是
建文帝再次召回了二人。建文四年(1402),下诏姚善兼督苏州、松江、常州、镇江、嘉兴五府兵
勤王。兵未集,燕王已入
京师。黄子澄藏匿于姚善的居所,相约一同航海起兵。姚善拒绝说:“公,
朝臣,当行收兵图兴复。善
守土,与城存亡耳。”黄子澄离去,姚善被麾下许
千户擒住献给
明成祖。明成祖审问姚善,说:“若一
郡守,乃敢举兵抗我耶?”姚善厉声不逊,不屈被杀。他的儿子姚节等四人被发配戍守边疆。