当时采取的措施中在军制上，定五营的名称为中吉、左辐（辅）、右翼、前锋、后劲；旗纛前营为黑色、后营为黄色、左营白色、右营红色、中营青色。军职虽仍设
权将军、
制将军、
果毅将军、
威武将军、
都尉、掌旅、部总、哨总等官，但在级别上似乎重新作了厘定，如在襄阳时期五营的主将授予制将军称号，这时却改授予相当于明朝
总兵级别的将领、其他军职大概也作了相应的调整。
李自成在
西安曾大规模检阅军队操练士马，“金鼓之声动地”。规定马兵越乱行列者处斩。所骑马“腾入田苗者斩之”这条纪律显然是为了保护农业生产。