散生于
气生菌丝上或生于
分生孢子座上、粘孢团及粘滑层中。形状多样：有马特型、美丽型、镰刀形、桔瓣形、长筒形、纺锤形等。大孢子顶胞形状有锥形、锲形、 鸟嘴形、渐尖、钝形等；基胞为有或无足跟。大型分生孢子的分隔数多为3-10分隔，有的分隔数更多。隔膜也不一样，有的分隔明显，而有的分隔不明显。产生 于分生孢子座上的孢子形态比气生菌丝上的典型和稳定。
(1)小型分生孢子：形态多样，多为单细胞，少数为1-3分隔。形状有卵形、椭圆形、肾形，少 数为瓜子形，梨形，纺锤形，哑铃形，披针形等。有的种类只有1-2种形状，有的种类具有多种形状，而有的种类缺乏小孢子或小孢子极少，或者只有在不良环境 中产生。小孢子形成于气生菌丝上，着生方式有单生，串生，假头状着生。
(2)大型分生孢子：散生于气生菌丝上或生于分生孢子座上、粘孢团及粘滑层中。形状多样：有马 特型、美丽型、镰刀形、桔瓣形、长筒形、纺锤形等。大孢子顶胞形状有锥形、锲形、鸟嘴形、渐尖、钝形等；基胞为有或无足跟。大型分生孢子的分隔数多为 3-10分隔，有的分隔数更多。隔膜也不一样，有的分隔明显，而有的分隔不明显。产生于分生孢子座上的孢子形态比气生菌丝上的典型和稳定。
(3)
厚垣孢子：镰刀菌的厚垣孢子形成于菌丝及分生孢子中，通常为圆形或卵圆形，壁光滑或有突 起，绝大多数无色，少数为褐色，肉桂色，多生于菌丝的顶端或中间。有的由大孢子部分细胞膨大直接形成。厚垣孢子的有无在镰刀菌分类中具有重要意义，但厚垣孢子的形状、着生方式等性状被认为是次要的。