复壮，指对已衰退的菌种(群体)进行纯种分离和选择性培养，使其中未衰退的个体获得大量繁殖，重新成为纯种群体的措施。狭义的复壮是一消极措施，一般指对已衰退的菌种进行复壮；广义的复壮是一积极的措施，即在菌种的生产性状未衰退前就不断进行纯种分离和生产性状测定，以在群体中获得生产性状更好的自发突变株。菌种退化是指群体中退化细胞在数量上占一定比例后，所表现出群体性能变差的现象。因此，在已经退化的群体中，仍然有一定数量尚未退化的个体。

在衰退菌种的细胞群中，一般还存在着仍保持原有典型形状的个体。通过纯种分离法，设法把这种细胞挑选出来即可达到复壮的效果。纯种分离方法极多，大体可分为两类，一类较粗放，可达到“菌落纯”水平（pure culture in colony level）；另一类较精细，可达到“菌株纯”的水平（pure culture in strain level），现表解如下：

对于因长期在人工培养基上移种传代而衰退的病原菌，可接种到相应的昆虫或动、植物宿体中，通过这种特殊的“选择性培养基”一至多次选择，就可从典型的病灶部位分离到恢复原始毒力的复壮菌株。例如，经长期人工培养的Bacillus thuringiensis会发生毒力减退和杀虫效率降低等衰退现象。这时，就可将已衰退的菌株去感染菜青虫的幼虫，然后再从最早、最严重罹病的虫体内重新分离出产毒菌株。

有人发现，若对S. microflavus “5406”农用抗生菌的分生孢子采用-10℃~-30℃的低温处理5~7天，使其死亡率达到80%左右。结果会在抗低温的存活个体中留下未退化的个体，从而达到了复壮的效果。

一般情况下，对于生产企业，菌种管理都要求对菌种进行定期的分离纯化，也就是说分离筛选一般都是在退化之前就进行的一种常规工作，是防止菌种退化或者生产育种而采取的一中积极措施。另外，在出现发酵水平较高和较低的情况下，也会进行菌种的分离筛选。前者的目的是期望从发酵液中分离出高产菌株，而后者则是期望从可能已经退化的种子中分离出尚未退化的菌株。