源自血液器官（如骨髓或胎肝）的一种非血细胞，可支持血细胞在体外的生长，形成骨髓基质的基质细胞也可来自间充质干细胞。基质细胞是人体内具有强分化能力和再生能力的功能细胞。

由水，无机盐，脂质，糖类，核苷酸，氨基酸和多种酶等组成。在细胞质基质中，进行多种化学反应。

胞质溶胶约占细胞总体积55%，其中存在几千种酶。大多数中间代谢(包括糖酵解、糖原异生作用以及糖、脂肪酸、核苷酸和氨基酸的合成)都是在胞质溶胶中进行的。胞质溶胶内约20% 是蛋白质。许多蛋白质可能直接或间接地与细胞骨架相结合，蛋白质分子之间也可能有选择性的亲合。因此，细胞质基质实质上是一个在不同层次均有高度组织结构的系统，而不是一种简单的溶液。然而，在普通透射电子显微镜下却看不到细胞质基质内的有形构造。

基质细胞和肿瘤细胞的相互作用在肿瘤细胞的生长过程中具有重要作用。例如：靠近皮肤表皮底层的基质细胞释放促进细胞分裂的生长因子，使得表皮从底层不断再生而顶层表皮细胞持续“蜕皮”。基底细胞癌之类的皮肤癌不能转移因为肿瘤细胞需要附近基质细胞支持其分裂。缺乏这些基底层生长因子会阻止癌症在身体里的转移。

基质细胞疗法是最新一代利用人体自身细胞治疗肝硬化的生物技术，也是最有希望治愈肝硬化的新疗法。SCT疗法通过提取人体具有分化功能的基质细胞(SCT)，经过GMP实验室培养扩增后，诱导为大量能够修复肝细胞的功能细胞，再通过静脉或介入的方式直接把这类细胞注入病人肝组织，直接实现对肝硬化的修复与再生。并且这类细胞进入人体后，会刺激免疫系统分泌因子及小分子物质对肝炎病毒细胞进行消灭，或转变为肝细胞，或激活体内肝原始细胞最终实现对肝硬化的治疗。