土合站位于三国山脉中谷川岳的脚下，同时也是
群马县内的普通铁道火车站中位于最北方的一座。该站最大的特点是下行月台位于新清水隧道内，因上下车人数相当少，所以未设电扶梯或电梯，要出站或者前往上行月台的话，必须先爬上一条462级、长338米的楼梯，然后经过一条143米长、24个梯级高的联络通道，下行月台与检票口间的高低差大约70米。因此，本站又被称为“日本第一的地下车站”。在日本发行的
列车时刻表中，会在“
高崎线·上越线·
信越本线下行”页面旁标注“从土合站的检票口到下行月台需要大约10分钟”，而在有人车站时代更是会在发车前10分钟就停止检票。另外，在站内的楼梯上还设置有可供乘客休憩的长椅。
虽然在一年中大多数时间乘客都很少，但有许多登山客会在夏秋时节来此车站攀登谷川岳。在
横山秀夫的小说《登山者》以及2005年的同名电视剧、2008年的同名电影的开头，也有对该车站内场景的描写。