国家农业生物安全科学中心坐落于北京市海淀区圆明园西路2号，由中国农业科学院申请建设，管理依托单位是中国农业科学院植物保护研究所。

2007年项目建议书获得国家发展改革委员会正式批复，2008年获得环境保护部批复， 2009年农业部对该项目初步设计和概算进行批复，2010年获项目建设工程规划许可证，2010年完成办理施工许可证，2013年完成建设投入试运行。

2024年7月3日，国家农业生物安全科学中心河南分中心在郑州揭牌成立。

“国家农业生物安全科学中心”是面向农业、林业、环保等领域，专门从事高危农林有害生物研究的综合性国家级创新平台，是国家生物安全体系的重要组成部分。安全科学中心由高级生物安全隔离实验室及温室（农业生物安全三级）、中级生物安全隔离实验室及温室（农业生物安全二级）、通用生物实验室、公用技术平台与公用设施、农业生物安全信息分析处理网络用房及相关辅助用房共计16897平方米，购置仪器设备109台/套、试验台通风柜等200台套。

国家农业生物安全科学中心是国际一流、设施可靠、功能齐全的现代化农林生物安全预防和控制科学技术研究基地，主要用途是从事高危农林有害生物灾变规律和防控理论与技术的研究，为国家和社会提供科学和技术服务。包括开展对不同安全级别的农林危险性外来入侵生物、农林高致害变异生物和农林转基因生物安全性的科学研究，生物安全信息服务，高水平农林生物安全人才培育和国内外合作与交流等。其主要用途体现在以下三个方面：

（1）引领科学研究与技术创新，攻克一批监测、预警、扑灭和控制主要高危农业有害生物的核心与关键技术，为防御有害生物对我国经济、社会和公共安全的威胁提供技术保障。针对高危农林有害生物（植物、昆虫和病原微生物）的预警、监测和控制三大科学问题，深入系统地开展预防预警的理论模式与评估体系、遗传分化与变异、快速进化与协同进化、寄主互作与系统抵御等方面的基础研究，揭示危险外来生物的入侵与发展机制，解析高致害变异生物的致害性产生与控制机制，发展农林生物安全科学的新理论、新方法和新途径。

（2）建成国内外农业生物安全科学技术交流平台 采用“开放与共享”的策略，利用国家农业生物安全中心的现代化科学设施，建立平台协作共享系统运行和管理办法，强化对公共科技资源开放利用的社会共享和监督，使其成为我国农林生物安全科学研究领域的国家平台，成为国际相同领域中有重要影响的研究基地。

（3）凝聚、培育国际农业生物安全高端人才我国有一批在国外从事农林生物安全研究的优秀科研人才，其中有不少人有意回国工作，但限于国内设施条件而尚未实现宿愿。该中心的开放运行不仅将凝聚一批优秀拔尖人才回国工作，还将促进我国农林生物安全研究队伍科研素质整体上的大幅度提高，源源不断地为国家培养专门从事农林生物安全科学研究与管理的高级人才。