内蒙古自治区呼伦贝尔市人民政府是呼伦贝尔市的一级国家行政机关，是呼伦贝尔市人民代表大会的执行机关，对呼伦贝尔市人民代表大会和内蒙古自治区人民政府负责并报告工作，在呼伦贝尔市人民代表大会闭幕期间，向呼伦贝尔市人民代表大会常务委员会负责并报告工作。

1945年8月日本投降，10月岭西地区建立呼伦贝尔自治省政府，1946年10月改称呼伦贝尔自治政府。1948年1月1日改称呼伦贝尔盟，归属内蒙古自治区政府。于1945年10月在岭东地区建立纳文慕仁省，1946年6月改称纳文慕仁盟，受中共领导的兴安省政府领导，1947年5月归属内蒙古自治政府领导。

1949年4月，呼伦贝尔盟和纳文慕仁盟合并，称呼伦贝尔纳文慕仁盟，简称呼纳盟。

1953年4月1日，成立内蒙古自治区东部行政公署 ，简称东部行署 ，署址设在乌兰浩特。同时撤销原哲里木、兴安、呼纳三个盟的建制，其中原呼纳盟的海拉尔、满洲里、乌兰浩特变为内蒙古自治区的直辖市，其工作委托东部行署代管。

1954年4月30日，撤销东部区行政公署 ，将原兴安盟和呼纳盟所辖地区合并，改尔呼伦贝尔盟，成立呼伦贝尔盟人民政府，作为一级政权，直属内蒙古自治区领导。盟政府设在海拉尔市。

1957年2月21日，呼伦贝尔盟人民政府改称呼伦贝尔盟人民委员会。

1958年6月1日，撤销呼伦贝尔盟人民委员会，改为内蒙古自治区的派出机构，设行政公署于海拉尔市，改称呼伦贝尔盟行政公署 。

1967年12月20日，建呼伦贝尔盟革命委员会，为临时权利机构，行使原呼盟行政公署职权。

1969年8月1日，呼盟大部分地域划归黑龙江省管辖，一部分（原兴安盟的大部分）划归吉林省管辖。

1979年7月，恢复1969年前的区划，呼盟重新划归内蒙古自区管辖。

1980年7月，恢复兴安盟建制，呼盟恢复1954年4月前的区划。

2001年10月10日，国务院批准撤销呼伦贝尔盟设立地级呼伦贝尔市；撤销海拉尔市设立海拉尔区。呼伦贝尔市辖原呼伦贝尔盟的阿荣旗、莫力达瓦达斡尔族自治旗、鄂伦春自治旗、鄂温克族自治旗、陈巴尔虎旗、新巴尔虎左旗、新巴尔虎右旗和新设立的海拉尔区；代自治区人民政府管辖满洲里市、牙克石市、扎兰屯市、额尔古纳市和根河市。

市长：及永乾

副市长：胡兆民、辛曙光、马跃东、梁劲松、杨子江、孙 微、林淑莉、贾效明

党组成员、副市长：文进磊

呼伦贝尔市发改委

呼伦贝尔市科技局

呼伦贝尔市人社局

呼伦贝尔市海拉尔区人民政府

满洲里市人民政府

牙克石市人民政府

扎兰屯市人民政府

额尔古纳市人民政府

根河市人民政府

阿荣旗人民政府

莫力达瓦旗人民政府

鄂伦春旗人民政府

鄂温克旗人民政府

陈巴尔虎旗人民政府

新巴尔虎左旗人民政府

新巴尔虎右旗人民政府

呼伦贝尔市扎赉诺尔区人民政府

呼伦贝尔市现辖14个旗市区。

其中有2个区 ：海拉尔区、扎赉诺尔区；

5个市：满洲里市、扎兰屯市、牙克石市、根河市、额尔古纳市；

7个旗：阿荣旗、莫力达瓦达斡尔族自治旗、鄂伦春自治旗、鄂温克族自治旗、新巴尔虎左旗、新巴尔虎右旗、陈巴尔虎旗。

68个镇、19个乡（其中13个民族乡）、19个苏木（其中1个民族苏木）、36个街道办事处。

呼伦贝尔市人民政府驻海拉尔区。