吴军10岁时师从
四川音乐学院王其书教授学习
笛子，13岁考入中国音乐学院附属中学，1992年被保送进中国音乐学院作曲系，毕业后留校任教。
现任中国音乐学院作曲系多媒体音乐中心助教。前外交部长
李肇星为2008年北京奥运会写歌曲《同一个世界 同一个梦想》的作曲，2008年第29届北京奥林匹克运动会开幕式音乐主创人员。中国音乐著作权协会会员。
2007年
河北电影制片厂、
八一电影制片厂联合出品的电影《亲兄弟》主题曲作曲电视剧《不回家的男人》音乐创作
2010年第13届
南宁国际民歌艺术节开幕式晚会《大地飞歌·2011》中《仪式一：共汇一江水》《仪式二：共浇一株苗》《仪式三：共享一棵树》编曲
2010年广西南宁国际民歌艺术节开幕式晚会《大地飞歌·2010》中歌曲
《弹起我心爱的土琵琶》《在那遥远的地方》《刘三姐组歌》编曲
朱桦演唱的《我怎么了》作词、作曲。这首歌在1998年被评为第五届
东方风云榜十大金曲之一
2009年与张艺谋、
王潮歌、
樊跃导演合作，创作《印象 五夷山》《印象 海南岛》音乐