门下有
规庵祖圆、道山玄晟、玉山玄提、钩叟玄江、金光竺翁、岩窦明投等人。其中，祖圆初参
无学祖元，后随侍普门，并于普门示寂后奉勒承袭第二世之法席，住山三十二年，大兴寺门。本派之基础虽由普门及祖圆所构筑，但在永仁七年（1299）龟山上皇下勒，令选拔器宇卓拔、才智兼全者为住持。此后付法传位即不依师资相承，而改为挑选诸山之英匠硕德任其职。因此，历世能放异彩者颇多。明治九年（1876）九月，临济宗诸派分立之际，独立为临济宗南禅寺派，别置管长。明治三十六年七月分立方广寺派，四十一年九月分立
向岳寺派。在本山及美浓（
岐阜县）永保寺、肥前（
佐贺县）
圆通寺设置专门道场，且联合临济、
黄檗宗各派经营紫野中学校，培育派内子弟。