南埔乡位处惠安县县域东北部，东北濒临湄洲湾与莆田县灵川乡、东庄乡隔海相望，西北与仙游县枫亭镇交界，西与涂岭乡接壤，南与山腰乡、后龙乡毗连。面积约79平方公里，乡政府设在柳厝街。东部沙格村有全国著名的天然深水良港，万吨杂货码头，年处理原油250万吨的省重点建设项目福建炼油厂即建在该乡东部的练马埔。

1949年9月，天马乡分属涂岭、坝头两区管辖，西部11个乡归涂岭区，东部4个乡归坝头区。1951年6月，南埔成立第九区公所，辖18个乡。1952年9月，析立施厝、仙境、槐山等3个乡，把土山、三川2个乡划归十二区。1955年10月，撤销南埔区公所(即原第九区)，划出10个乡归涂岭区，3个乡归山腰区，2个乡归郭厝区。1956年并区并乡时(全县并为7个区、66个乡、8个镇)，成立南埔区，辖14个乡。包括南埔、后龙地区全部。1958年撤区并乡，设南埔乡，辖9个联社、20个分社、335个生产队；玉湖乡辖4个联社、15个分社、262个生产队。尔后，两个乡合并为南埔乡，下辖12个分社、158个生产队。9月，人民公社化，隶属超先人民公社，设南埔管理区，辖20个生产大队。1961年冬析分小社，成立南埔人民公社，辖27个生产大队(其中25个农业大队、1个渔业大队、1个运输大队)、420个生产队(其中403个农业生产队、8个渔业队、5个运输队、3个林业队、1个畜牧队)。1962年析出鹅头、东张、玉山、梨山、浮洋、山沟、界路、塘头、打厝、西枫、仑头、邱厝、仙境、柳厝，为35个生产大队。1966年春“四清”后期，撤并鹅头、东张、梨山、浮洋、山沟、界路、打厝、西枫、玉山，辖26个生产大队。1980年又析立鹅头、玉山、西枫、东张等大队，生产大队增至30个。

1984年10月，成立南埔乡人民政府。1985年1月，生产大队改称村民委员会，建立30个村委员会，下辖426个村民小组。同年4月11日，省政府批准设立肖厝镇；同时撤销南埔、后龙、山腰3个乡的建制归肖厝镇，但未即施行。1989年12月，计辖30个行政村、109个自然村。有21747户、101596人。

鸩林行政村辖南庄、港西等2个自然村。

介山行政村辖蚵寨、交界、南山、石鼻、东邱、清厝等6个自然村。

河阳行政村辖潘厝1个自然村。

鹅头行政村辖鹅头、窑郑、牙口等3个自然村。

玉山行政村辖羊角山、铁打墘等2个自然村。

玉湖行政村辖东陈、新东陈等2个自然村。

陈张行政村辖东张、青枫林等2个自然村。

狮东行政村辖东吴、蒋厝等2个自然村。

大前行政村辖前潘、长潭仔、大路等3个自然村。

东凉行政村辖厝场、楼下仔、下凉尾、东潘、后帝、新宅等6个自然村。

下朱行政村辖下朱、下朱尾等2个自然村。

岭头行政村辖岭头、浮洋、海头、南边、桥仔头、下凉、大门头、洋面、前炉格、下窑等10个自然村。

槐山行政村辖槐窑、上庄、格头等3个自然村。

南埔行政村辖南埔、介路、山仔路、田厝、虎空口、顶溪、山沟、草溪、前沁等9个自然村。

天湖行政村辖白井、打厝、半尾、后张尾、清厝等5个自然村。

塘头行政村辖塘头、石牛、寮仔、埔尾、惊尾等5个自然村。

柳厝行政村辖柳厝、坝头仔、枫林坑等3个自然村。

天竺行政村辖林柄、后郑、地上、过溪、地头、倒桥、油园等7个自然村。

凤翔行政村辖田头、南埔头、黄河、马厝、文坂等5个自然村。

仙境行政村辖山仔、后坑、下楼尾、蔡坑头、蔡坑尾等5个自然村。

西枫行政村辖西枫1个自然村。

外厝行政村辖外厝1个自然村。

施厝行政村辖施厝、蔡厝等2个自然村。

仑头行政村辖仑头、张具等2个自然村。

邱厝行政村辖港口、前邱、后邱等3个自然村。

柯厝行政村辖柯厝、北辋等2个自然村。

先锋行政村辖刘厝、前陈、丁宁、西宁、后坑仔、后坑店仔、枫厝、林头、港墘、前厝、前虎山等11个自然村。

沙格行政村辖沙格、许店等2个自然村。

肖厝行政村辖肖厝1个自然村。

惠屿行政村辖惠屿1个自然村。