南京市公共卫生医疗中心
用地面积约190亩，
总建筑面积约11万平方米，拥有约900张床位。整个工程以
青龙山绿色生态环境为背景，建设的主要内容包括：传染病专科、
结核病专科、爆发烈性疾病专科、小综合病种、救援中心、办公和辅助用房、科研和教学用房、员工生活区等；项目建成后将成为南京市以“小综合、大专科、强防治、应突发”为特色，集综合、消化道与
呼吸道、接触性与非接触、暴发性等病种专科特色的精细诊疗为主的，综合诊疗为辅的防治、救援、应急的现代化大型公共卫生医疗防治中心。
与其他所有医疗机构设置均不一样的是，所有传染病区的进出口不是面向中心广场方向，而是设置在处于建筑群外围地形高处的相对独立区域，并面向外围打开，这样可让各个病区的病人从外围进入病区，有效避免交叉感染。
呼吸道感染病区，
住院部设置在三层以上，一二两层是门诊和医技区。这里采用一种别致的
新风系统，通过室内气流人工组织，实现
气压梯度管理，污染空气区域为负压区，空气不会向外扩散，
洁净区区域的空气气压最高，
半污染区气压相对较低，这可让建筑中的气流呈现单向流动，最末端的出风口安装了纳米消毒装置，可确保从这幢楼出去的空气没有污染。
三幢建筑内有数十部电梯，安排也很有讲究，洁梯（供医护及探视家属乘坐）和污梯（供病患使用）严格分流。另外，传染病各楼层均设有
隔离带，人员须经过消毒净化措施才能穿越。
南京市公共卫生医疗中心的建设对于进一步促进南京市
医疗卫生资源的
均衡布局和
医疗保健事业创新发展，科学构筑和优化南京市
公共卫生体系具有十分重要的作用，同时对于进一步加强南京市卫生医疗的
科学研究、学习和培训，提高南京市内、外人才、技术和经验交流水平等亦具有重大的现实意义。
2015年8月，南京市公共卫生医疗中心项目摘得2015年度
国际项目管理大奖金奖，这是继
神舟六号载人飞船、
中海油惠州炼油等国家特大型项目之后，中国第六个获此殊荣的项目，也是全球第一个获此殊荣的大型传染病医院项目。
2020年1月，在抗击新型
冠状病毒的战斗中，南京市公共卫生医疗中心作为定点收治医院，收治了南京发现的全部确诊病人。1月27日，南京市委市政府紧急决策，在现有南京市公共卫生医疗中心收治能力基础上应急扩容；1月29日，由市建委、市
城建集团组建了
应急工程现场指挥部，协同高效、有条不紊推进基础土建、板房、配套道路和给排水等各项建设。2月1日动工，2月13日主体建筑完工，随后配合医院使用需求，安装病床家具、相关
医疗设备等。