南京大学欧洲研究中心成立于2005年11月。 2005年11月，在 南京大学校领导的大力支持下，经社科处牵头，学校多个学科的有关专家组成了一支专门研究欧洲问题的攻关队伍，宣告了南京大学欧洲研究中心的相关活动正式启动。

这一项目的总经费达到298150.15欧元，其中的80%由欧方提供。项目下属“欧洲一体化背景中的身份认同问题：当代欧洲后现代语境中的主体性研究”、“欧洲的灵魂：欧洲认同与民族国家的重新融合”、“欧洲社会的整合与欧洲认同”、“欧洲经济一体化的基础”、“ 欧洲经济一体化的基础机制、前景”、“欧洲法律一体化与成员国法律欧洲化研究”、“欧洲认同的制度建构”六个子项目，均由我校该领域的优秀专家学者负责主持。同时，中心还将开设“欧洲学导论”、“ 欧洲的语言政策和文化认同”、“ 欧洲种族与民族的融合问题”、“ 开放宏观经济学”、“ 当代欧洲高等教育研究”、“ 欧洲统一合同法与欧洲认同”、“ 一体化进程中的欧洲社会政策”、“ 欧洲统一性与多样性的建构与认同”八个新课程。意在通过对上述课题的深入研究，全面认识当前的欧洲一体化趋势，促进中欧间的合作交流。

现今，中欧合作项目下属各子项目的任务分工和经费分配工作均已完成，中心力求保质按期完成研究任务，取得高质量的学术成果，为今后争取新的中欧合作项目，谋求新的合作关系打下良好基础。

此外，中心的交流与教育平台已经建成。研究生院已经落实了2007年欧洲学研究生的招生与培养工作。而学校也已与欧方高校建立了交流合作关系，从2007年上半年起，中心将与欧方先后两轮互派学者学生进行交流。在各项工作的运作过程中，中心与南京大学各相关部门都建立了良好的合作关系，特别是社科处的各位领导与工作人员，给予了中心多方面的支持和帮助。中心还与苏亚会计审计事务公司在会计与审计方面进行合作，为经费使用与审计工作的正常进行提供了重要保证。