单独检查是联合检查的对称，专业检查的一种形式。一般指税务专管员对所管的纳税户进行自管自查或对口检查。又有专管员自查和专管员互查两种具体形式。前者是专管员对自己所管的纳税户进行单独检查; 后者是专管员相互之间各自对对方所管的纳税户进行单独检查。

单独检查，由于专管员对管区的情况比较熟悉，故能及时发现问题，纠正错误，检查成本也较低。但由于检查力量比较单薄，易出现漏查情况，加上每个税务专管员的政策水平和业务技能不尽相同，检查的深度和广度也不一样，特别是在目前税种较多、经济业务复杂的情况下，容易产生遗漏疏忽的问题。另外，由于专管员单独检查，往往存在片面性，不易发现自己工作中的弱点。因此，这种检查形式，一般较适用于日常性的纳税检查。