医史博物馆馆址位于学校图书馆九楼，展厅300余平方米，大体分为序厅、陈列主题和复原陈列三部分。在介绍中国医药学悠久历史和光辉成就，进行医学史研究和教学，以及中外文化交流等方面发挥着重要作用。先后我馆在有关医学文物方面研究工作活跃，取得多项成果。成都中医药大学医史博物馆是我国西南地区唯一的医药卫生专业博物馆，以率先在全国举办地方医史和名医专题阵列闻名。现辟有四川医药卫生文物资料、西南少数民族医学、四川近现代名医、建国50年来四川中医药著作四个基本陈列，正积极筹建养生保健专题陈列。

馆藏文物、标本500余件，名医史料600余册（件），西南少数民族医学史料100余册（件）。

中汉代盛药陶罐，宋代铜唾壶，名医冉雪峰手稿，叶心清行医“金针”，王朴成、王伯岳在川行医的“开门问疾苦，闭门阅沧桑”木匾。

西汉人体经脉漆雕是反映我国早期经脉学说的重要人体模型。较宋代王惟一所铸针灸铜人早1000多年，其上纵行19根线条代表人体正经9条，奇经1条。

医学官印是反映我国古代医事制度的重要物证。