北京大学临床心理中心于2002年7月12日由
北京大学医学部批准成立。该中心依托
北京大学精神卫生研究所、心理系、医学心理学教研室的综合优势，并整合北京大学学生心理咨询中心、校医院心理咨询中心及各临床医学院心理科的相关力量，组成多学科合作、优势互补的联合机构，旨在建设达到国内领先水平和国际先进水平、具有多种功能的临床心理中心。
2007年9月,报请
北京大学医学部批准，该中心进行组织结构的调整。于欣任中心主任（兼职），唐登华任中心常务副主任，钱铭怡和胡佩诚任中心副主任。成立北京大学临床心理中心办公室，设立在
北京大学精神卫生研究所，林红任办公室主任。
1、 临床工作： 在北大六院病房、门诊及其它相关单位规范开展心理治疗和心理咨询工作，为患者、学生、教职员工及社会上的来访者提供临床心理治疗与咨询服务，并以此作为教学及科研的主要基地。
2、 教学：（1）举办精品的国家级继续教育项目，如全国心理治疗师理论及实践操作强化培训班，全国心理治疗师高级培训班、心理咨询强化培训班、家庭治疗连续培训项目及经典的国际培训项目。（2）定期组织案例讨论、督导及培训，为在职职工的专业成长提供条件，并搞好学科梯队建设。（3）招收一定数量的研修生，举办心理咨询与治疗高级实践（临床取向）研修班。
3、 科研：整合北大自身的资源，开展具有中国特色、国内领先、国际水平的临床心理学术研究，如文化与心理治疗、青少年心理卫生、家庭心理健康、具有中国特色的心理治疗理论及方法、社会发展与心理健康等。
4、 社会工作：积极参与心理健康的教育；为国家相关部委提供一定的政策建议及咨询，如卫生部心理治疗师资格考试条例、教育部学生心理健康教育指导、有关和谐社会与心理和谐等；对有关的社会现象及问题发表相关的观点和建议。