别峰庵始建于宋代，宋代高僧佛印法师有诗云：“绝顶无寻处，何人为指南。回头见知识，原在别峰庵”。明人章诏又有诗云：“竹密凝无路，云开忽到门。转看诸院子，独见一峰尊。，’深山孤寺，人迹罕至的别峰庵，庵内北侧有小斋三间，天井中有一花坛，桂花树两株，修竹数竿，环境清雅幽绝。这里就是世称诗、书、画“三绝’’的清朝著名画家、扬州八怪之一的郑板桥于雍正年间在此攻读之处。现在过道门头上题有“
郑板桥读书处”的横额，门上还保留着当年郑板桥手书“室雅何须大，花香不在多”的对联，面对此情此景，缅怀书屋故人，不由使人产生物是人非的感慨。
郑板桥，名燮，江苏省兴化县人，乾隆年间进士。他擅画兰竹，书法以隶、楷、行三体相融。他的字、画、诗，世称“三绝”，在“扬州八怪”中最负盛名。他深爱在焦山修行，留下了许多墨竹诗画作品。他《题自然庵画竹》一诗云：
静室
焦山十五家，家家有竹有篱笆。画来出纸飞腾上，欲向天边扫暮霞。
还有他手书的“难得糊涂”、“吃亏是福”的拓片，更为人们争相购买。此外郑板桥还曾为旧时的自然庵写过对联：“山光扑面因新雨，江水回头为晚晴。”同时还在过去的海神庙里题过对联：“楚尾吴头，一片青山入座；淮南江北，半潭秋水烹茶。”这些美妙的佳话，常为后人赞扬。