种子植物的分枝方式，有三种类型：（1）
单轴分枝，主茎上的
顶芽活动始终占优势，因而形成具有明显、笔直的主干的分枝方式。在这种分枝型式中，主干即主轴，由顶芽不断地向上伸展而成。多数
裸子植物和部分
被子植物——如
杨树、
山毛榉和许多
草本植物具这种分枝方式。（2）
合轴分枝，主干的顶芽生长一个时期后，
生长迟缓、死亡或分化为
花芽，而由近顶芽的
腋芽代替原有顶芽继续生长，发育成新枝。以后再过一段时间（或每年）仍以这种方式形成一段新枝，因而形成了由多个轴联合成的具曲折主干的分枝方式。
番茄、
枣树、核桃和
苹果等大多数被子
植物的茎，都属于这种类型。（3）
假二叉分枝，具有对生叶的植物，在顶芽停止生长或分化为花芽时，由其下方两侧的腋芽同时发育形成二叉状分枝的分枝方式。这和
低等植物那种由
顶端分生组织分为2个，因而形成的真正的
二叉分枝不同，故称假二叉分枝。如
石竹、
丁香、
接骨木和
茉莉等。