清光绪三十二年（1906年）九月，清政府改革官制，将原来的练兵处并入陆军部，其军令司改为军谘处，附于陆军部。下设总务厅，置军咨使二人，以副、协都统或正参领充任。又设五司（测地司，第一——第四司），分任执掌。

历史沿革

1909年，清朝末期效仿德国，军谘处奉旨独立，脱离陆军部，名称不变，作为独立的军令部门，地位相当于辅佐摄政王载沣统率全国武装力量的“总参谋部”。毓朗被任命为军谘处管理大臣。

1910年清朝改制，撤销军机处，成立责任内阁，但不再管理军事事务，转由军谘处负责，军谘处直接向皇帝负责。

宣统三年（1911年）四月，清政府成立“皇族内阁”后，将军谘处改为军谘府。原管理大臣改称军谘大臣，载涛、毓朗为军谘大臣。

军咨府下设7厅，分别为总务厅，第一厅（作战），第二厅（情报），第三厅（交通与通信），第四厅（测量），第五厅（史志）与海军厅，厅下设科。

其中成立于宣统元年（1909年）五月的军谘处第二厅是中国近代历史上第一个专门对外的间谍机构。第二厅下设五科：第一科“掌管日本、朝鲜之谍报及对其作战法，并该国驻扎武官调查员事宜”；第二科的侦察对象是俄国；第三科负责“英、美与用英语国及其属地”；第四科的侦察对象是“德、奥及用德语国及其属地”；第五科负责“法、意及用法语国及其属地”。该厅编有厅长1人，副官1人，科长5人，一等科员13人，二等科员13人，三等科员10人，一、二、三等录事共15人，额外科员、录事无定额。