学校于1984年创立，是香港佛教联合会属下的津贴全日制小学；开办经费由明珠佛学社捐出，故学校以该社名字命名。学校的办学宗旨是秉承佛陀慈悲度世精神，培养学生德性，启发学生智慧，务求品学兼优、五育并重。学校在2005年与香港佛教联合会属下中学佛教黄允畋中学结成“一条龙学校”。

学校信息

佛教明珠学校因收生不足而被教育统筹局勒令，自2006至2007学年起，停止开办小一班级，最快三年后停办。然而，由于学校的教学大楼才刚揭幕，建筑费用高达3,000万元，设施达到“千禧校舍”水平。后来，校方向教统局申请“特别视学”（上诉），如学校的整体表现达良好水平，局方便会容许学校从新参加2007学年的“小一入学统筹办法”。

教育统筹局质素保证分部于2006年5月16日至19日及22日到校作特别视学。结果，视学报告指出，学校在多方面的表现都未达良好水平；其中，学生在英文科的表现欠理想，只有约半数考获及格或以上成绩。学校最终于2009年关闭。