交通大学上海部分（1957—1959）的前身是创建于1896年的南洋公学，是上海交通大学的前身。

1955年，由于东南沿海局势紧张，党中央、国务院决定交通大学由上海全部迁往西安。1957年，由于国际形势趋于缓和，根据交通大学的实际情况和上海、西安两地的建设需要，国务院决定交通大学的大部分科系师生、档案文献、图书仪器迁往西安，作为交通大学的西安部分；小部分留在上海并与原上海造船学院及筹办中的南洋工学院合并，作为交通大学的上海部分，两部分为一个学校，统一领导。1959年3月，交通大学的西安、上海部分均列为全国重点大学之一。

1959年7月31日，国务院批准交通大学上海部分、西安部分分别独立为两所学校。同年，经国务院批准，交通大学上海部分正式定名为上海交通大学。

南洋公学（1896-1904）：十九世纪末，甲午战败，民族危难。近代著名实业家、教育家盛宣怀秉持“自强首在储才，储才必先兴学”的信念，于1896年在上海创建了南洋公学，这是我国最早兼有师范、小学、中学和大学这一完整教育体系的学校，是交通大学的前身。

商部高等实业学堂：1905年，南洋公学划归商部，改名为高等实业学堂。

邮传部上海高等实业学堂：1906年，学校改隶邮传部，校名也随之更改为邮传部高等实业学堂。

南洋大学堂：1911年11月6日，辛亥革命刚刚爆发之际，唐文治校长宣布：“本校自即日起改名中国南洋大学堂” ，之后带头剪辫，以示拥护革命，摆脱封建旧制的束缚。

交通部上海工业专门学校（1912-1921）：1912年，学校改隶北京国民政府交通部，更名为交通部上海工业专门学校。并将铁路科改为土木科，电机科改为电气机械科。1918年3月，学校又增设铁路管理科，这是我国设立此科之开端，开创了工管结合的先河。

交通大学上海学校（1921-1922）：1921年，叶恭绰任北洋政府交通总长时，将交通部所属三所高校（上海、北京及唐山）统一更名为交通大学。学校定名为交通大学上海学校，并在全国率先成立董事会，校长亦由董事会选举产生。叶恭绰当选为校长，张铸为沪校主任，凌鸿勋和张廷金为副主任。学校在原有电机科外又增设了机械科。

交通部南洋大学（1922-1927）：1922年4月，由于政局变动，叶恭绰出走海外，交通大学随后又被分为南洋大学、唐山大学、北京交通大学三校。

交通部第一交通大学：1927年7月，南京国民政府交通部决议改组南洋大学为交通部第一交通大学，唐山大学为第二交通大学，北京交通大学为第三交通大学。

国立交通大学（上海本部）（1928-1942）：1928年，为加强对交通教育的管理，交通部将分立的第一、第二、第三交通大学再次合并统称交通大学，同年10月，南京国民政府为加强全国铁路管理权，增设铁道部，学校移归铁道部管辖，将设在上海、唐山、北平三处的交通大学各学院合并，统称铁道部交通大学，分上海本部、北平铁道管理学院和唐山土木工程学院。

国立交通大学（重庆总部）（1942-1946）：1942年日军侵占上海租界后，交通大学总部从上海转移到重庆九龙坡。此时期，交大开展院系建设。重庆商船专科学校并入交大组建造船等新专业，创办电讯研究所。学校规模扩大，教学设施、条例逐步完善。

国立交通大学（1946-1949）：抗日战争胜利后，三校各自迁回原址。1946年起，三校各自独立。在上海的仍沿用国立交通大学校名，在唐山的改称国立唐山工学院，在北平的改称国立北平铁道管理学院。

交通大学（1949-1957）：上海解放后，交大师生员工以极大的热情投入到教学以及中华人民共和国的建设事业之中。学校在华东教育部领导下，明确交大是理、工、管理类大学，其任务是为新中国培养建设人才。1952年全国进行大规模院系调整，交大由10个系、1个专修科调整为机械、电机、造船3大类、7个系。开办工农速中和工农调干生班。开展学习苏联经验的教学改革，走按专业培养专门人才的道路。1953年恢复招收研究生。1955年，国务院根据国家经济建设发展战略的需要，决定交通大学主体内迁西安；1957年，分设为交通大学西安、上海两个部分，实行统一领导。

交通大学上海部分（1957-1959）：1959年，两部分分别独立建校，西安部分定名为西安交通大学，上海部分定名为上海交通大学。此时期学校提出今后长期任务是提高教学质量，开展科学研究；学习苏联要与中国实际相结合；要大胆创造，主要专业课的教材要自己编写。各方面的工作均取得了较大进展。

上海交通大学（1959- ）：这段时间的中后期是上海交通大学蓬勃发展时期。尤其是20世纪70年代后期，中国的改革开放，为上海交大跻身高水平知名大学行列提供了新的历史机遇。历任党政领导和全校师生一道，抓住机遇、励精图治，为提升学校的办学水平和学术地位，积极开拓、敢为人先、历尽艰辛。学校先后进行了人事管理制度、教育教学、科技管理、后勤社会化和学校综合体制改革等多项改革实践；坚持“以人为本”的办学理念，调动了广大教师、学生参与教学活动的积极性，拓展学科领域，增强创新能力，壮大学术研究队伍、扩展校园规模，从总体上大幅度提高了办学水平。