乞伏暮末在位的三年中，
西秦遭到强邻
北凉的进攻和
胡夏的进逼，情势危急；而暮末对内又政刑酷滥，弄得众叛亲离。在此风雨飘摇的三年中，身为皇长子和丞相的元基，临危授命，曾代替暮末镇守旧都
枹罕，带领士兵几次击退
北凉的侵略。虽然最后没能挽救
西秦的灭亡，但也拼尽了全力，堪称西秦末期的一位中流砥柱。
永弘四年（431年）
胡夏攻西秦都城
南安，暮末投降，西秦灭亡。不久，暮末和500多宗室一起被
胡夏皇帝
赫连定所杀。此后史书再没有关于元基的记载。以他对
西秦国和弟弟暮末的忠诚，推测他不会在国亡时背弃暮末独自逃跑，他很可能在431年一起被
赫连定杀害了。当然，关于他下落的史实期待进一步的考证。
卷117：
义熙十一年（乙卯，公元四一五年）西秦王炽磐子元基自长安逃归，炽磐以为尚书左仆射。
卷121: 元嘉五年（戊辰，公元四二八年）五月，
秦文昭王炽磐卒，太子暮末即位，大赦，
改元永弘......
秦王暮末以
右丞相元基为侍中、
相国、
都督中外诸军、
录尚书事......
河西王蒙逊因秦丧，伐秦西平。西平太守麹承谓之曰：“殿下若先取乐都，则西平必为殿下之有。西平苟望风请服，亦明主之所疾也。”
蒙逊乃释西平，攻乐都。相国元基帅骑三千救乐都，甫入城，而
河西兵至，攻其外城，克之；绝其水道，城中饥渴，死者太半。东羌乞提从元基救乐都，阴与
河西通谋，下绳引内其兵，登城者百馀人，鼓噪烧门；元基帅左右奋击，河西兵乃退。十二月...
河西王蒙逊伐秦，至磐夷，秦相国元基等将骑万五千拒之。
蒙逊还攻西平，征虏将军出连辅政等将骑二千救之.
元嘉六年（己巳，公元四二九年）五月,河西王蒙逊伐秦，
秦王暮末留相国元基守
枹罕，迁保定连。
卷122:元嘉八年（辛未，公元四三一年）夏主击秦将姚献，败之；遂遣其叔父北平公韦伐帅众一万攻
南安。城中大饥，人相食。秦侍中、征虏将军出连辅政，侍中、右卫将军乞伏延祚，
吏部尚书乞伏跋跋，逾城奔夏；
秦王暮末穷蹙，舆榇出降，并
沮渠兴国送于上邽......六月，夏主杀
乞伏暮末及其宗族五百人。