中国科学技术大学研究生院科学岛分院成立于2015年1月7日上午，又名中国科学院合肥物质科学院研究生院座落在合肥市风景秀丽的蜀山湖畔“科学岛”上，是一个以承担国家重大科研项目为主、高技术应用开发研究与研究生培养并重的综合性科学研究基地。拥有
中科院等离子体物理研究所、
中科院安徽光学精密机械研究所、
中科院固体物理研究所、中科院智能机械研究所、中科院强磁场科学中心、中科院核能技术安全研究所、
先进制造技术研究所、技术生物与农业工程研究所、医学物理中心、应用技术研究所10个研究单元，其中正高级人员255人，副高级人员513人，包括两院院士4人、“新世纪百千万人才工程”国家级人选5人、国家杰出青年基金获得者5人、国家“973”计划首席专家26人、国家“863”计划项目负责人34人、“万人计划”入选者3人、中科院“百人计划”入选者69人、安徽省“百人计划”4人。通过组织优势科研团队，研究所组织和承担国家重大重点科研任务的能力不断加强，形成
等离子体物理、纳米材料、大气环境等多个创新团队和973、863团队。
科学岛分院拥有20多个装备优良的实验室、研究中心和10多个大型技术物理实验平台，包括全超导托卡马克东方超环EAST、EAST辅助加热、稳态强磁场等3项国家大科学工程；国家环境光学监测仪器工程中心，国家环保部环境光学监测技术重点实验室，国家“八六三”计划大气光学重点实验室，国家“八六三”计划智能机器人传感技术实验室，国家民委农业信息技术联合实验室；中科院材料物理、离子束生物工程、通用光学辐射定标与表征、大气成份与光学、新型薄膜太阳能电池、环境光学监测等6个重点实验室；安徽省光子器件与材料、纳米材料与技术、仿生感知与先进机器人等6个实验室。
科学岛分院是中国科学院重要的科技创新基地、高技术发展基地和研究生培养基地之一，设有物理学博士后流动站3个，大气科学博士后流动站1个，博士点7个，学术型硕士点16个，专业型硕士点9个。研究生导师380名，其中博士生导师185名，硕士生导师185名。在学研究生1361名，博士生571名，硕士生790名。